69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2992 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2992  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  290  4e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4232  protein of unknown function DUF1469  63.93 
 
 		 145 aa  118  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0561  protein of unknown function DUF1469  50.75 
 
 		 142 aa  117  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0221  hypothetical protein  52.94 
 
 		 202 aa  117  7e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.253727 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0051  protein of unknown function DUF1469  50 
 
 		 142 aa  116  9e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1321  protein of unknown function DUF1469  57.52 
 
 		 175 aa  114  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0347  hypothetical protein  47.01 
 
 		 140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0809  protein of unknown function DUF1469  47.97 
 
 		 142 aa  111  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6022  hypothetical protein  43.61 
 
 		 156 aa  106  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6667  hypothetical protein  52.52 
 
 		 193 aa  98.2  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126358  normal  0.676846 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2073  protein of unknown function DUF1469  49.23 
 
 		 137 aa  92  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01420  Protein of unknown function (DUF1469)  39.72 
 
 		 155 aa  92  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0555  protein of unknown function DUF1469  43.75 
 
 		 180 aa  89.4  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000647144 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4481  protein of unknown function DUF1469  37.5 
 
 		 157 aa  80.5  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.105215 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4294  hypothetical protein  38.46 
 
 		 248 aa  80.1  0.000000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.121888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0321  hypothetical protein  38.4 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.202745  normal  0.194337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1772  hypothetical protein  40 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0178  hypothetical protein  32.82 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4774  protein of unknown function DUF1469  40.71 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.487422  normal  0.301166 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1759  hypothetical protein  37.01 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0234108 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2283  hypothetical protein  42.5 
 
 		 134 aa  67  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.122746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2236  hypothetical protein  42.5 
 
 		 134 aa  67  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861722  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2275  hypothetical protein  42.5 
 
 		 134 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1384  protein of unknown function DUF1469  39.02 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000799445  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0724  protein of unknown function DUF1469  37.06 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2340  protein of unknown function DUF1469  32.37 
 
 		 157 aa  62  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0344  hypothetical protein  32.26 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2903  protein of unknown function DUF1469  39.5 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6344  hypothetical protein  41.46 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.443827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2210  hypothetical protein  39.17 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.554398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27570  Protein of unknown function (DUF1469)  34.11 
 
 		 138 aa  57  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2383  putative integral membrane protein  36.51 
 
 		 133 aa  57  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0168516  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1045  hypothetical protein  36.51 
 
 		 133 aa  57  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0593921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25370  Protein of unknown function (DUF1469)  32.91 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0475  hypothetical protein  35.48 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34040  Protein of unknown function (DUF1469)  31.71 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0932  hypothetical protein  34.81 
 
 		 133 aa  53.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1378  hypothetical protein  31.39 
 
 		 169 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0194818  normal  0.100632 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0210  hypothetical protein  36.21 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0417  protein of unknown function DUF1469  36.8 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0343446  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5428  hypothetical protein  30.15 
 
 		 175 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34600  hypothetical protein  37.84 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36060  Protein of unknown function (DUF1469)  35.48 
 
 		 169 aa  51.6  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328772  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0131  hypothetical protein  30.88 
 
 		 153 aa  50.8  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.241414  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0525  protein of unknown function DUF1469  36.89 
 
 		 168 aa  50.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.822053  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4815  protein of unknown function DUF1469  37.84 
 
 		 131 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3054  hypothetical protein  43.1 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0916548  normal  0.287496 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1591  hypothetical protein  32.12 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12680  Protein of unknown function (DUF1469)  32.65 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1891  hypothetical protein  36.36 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.373064  normal  0.485358 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3353  protein of unknown function DUF1469  36.5 
 
 		 145 aa  47.8  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5356  protein of unknown function DUF1469  28.78 
 
 		 171 aa  47.4  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.586134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4599  hypothetical protein  28.68 
 
 		 130 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2137  hypothetical protein  34.11 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.375802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1993  protein of unknown function DUF1469  40.16 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.122307  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1006  hypothetical protein  36.22 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0515851  hitchhiker  0.00247908 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1247  hypothetical protein  27.69 
 
 		 129 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.391441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4897  hypothetical protein  29.41 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.912667  normal  0.0700179 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4811  hypothetical protein  29.41 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.674359  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3560  hypothetical protein  32.82 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.462126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5198  hypothetical protein  29.41 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0142568  hitchhiker  0.000165751 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13700  transmembrane protein  27.97 
 
 		 172 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0470389 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0512  protein of unknown function DUF1469  31.33 
 
 		 175 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0334  hypothetical protein  40.62 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5621  protein of unknown function DUF1469  29.77 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.182455 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3512  protein of unknown function DUF1469  38.71 
 
 		 132 aa  41.2  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.377984 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3900  putative nutrient deprivation-induced protein  27.61 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0615251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4179  hypothetical protein  32.2 
 
 		 136 aa  40.8  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.865834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1438  protein of unknown function DUF1469  30.23 
 
 		 130 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.157465  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>