38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0131 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0131  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  305  1.0000000000000001e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.241414  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0210  hypothetical protein  46.36 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0475  hypothetical protein  40.83 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0555  protein of unknown function DUF1469  34.59 
 
 		 180 aa  78.6  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000647144 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0561  protein of unknown function DUF1469  35.25 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0051  protein of unknown function DUF1469  34.43 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5332  protein of unknown function DUF1469  39.68 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.113739 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0347  hypothetical protein  32.03 
 
 		 140 aa  70.1  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01420  Protein of unknown function (DUF1469)  29.2 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0260  protein of unknown function DUF1469  36.97 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.864061  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0724  protein of unknown function DUF1469  33.33 
 
 		 158 aa  62  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36060  Protein of unknown function (DUF1469)  31.01 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328772  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3925  protein of unknown function DUF1469  28.33 
 
 		 171 aa  60.5  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.962598  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0809  protein of unknown function DUF1469  37.25 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0417  protein of unknown function DUF1469  31.3 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0343446  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25370  Protein of unknown function (DUF1469)  31.13 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4843  protein of unknown function DUF1469  36.14 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13700  transmembrane protein  27.27 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0470389 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5198  hypothetical protein  32.82 
 
 		 170 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0142568  hitchhiker  0.000165751 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4811  hypothetical protein  32.82 
 
 		 170 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.674359  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4897  hypothetical protein  32.82 
 
 		 170 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.912667  normal  0.0700179 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1378  hypothetical protein  30.25 
 
 		 169 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0194818  normal  0.100632 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4481  protein of unknown function DUF1469  30.53 
 
 		 157 aa  51.2  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.105215 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2992  hypothetical protein  30.88 
 
 		 146 aa  50.8  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12680  Protein of unknown function (DUF1469)  30.53 
 
 		 160 aa  50.8  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2903  protein of unknown function DUF1469  37.04 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5428  hypothetical protein  29.41 
 
 		 175 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0344  hypothetical protein  32.23 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0525  protein of unknown function DUF1469  29.93 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.822053  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1759  hypothetical protein  35.45 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0234108 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34040  Protein of unknown function (DUF1469)  35.45 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2073  protein of unknown function DUF1469  33.33 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3353  protein of unknown function DUF1469  34.75 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1552  hypothetical protein  34.88 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1831  protein of unknown function DUF1469  34.88 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.371829 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4599  hypothetical protein  28.71 
 
 		 130 aa  41.2  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1689  protein of unknown function DUF1469  36.05 
 
 		 138 aa  40.8  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1475  protein of unknown function DUF1469  36.76 
 
 		 129 aa  40.8  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00110957  normal  0.391002 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>