50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1378 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1378  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  338  2e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0194818  normal  0.100632 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5428  hypothetical protein  88.76 
 
 
175 aa  286  1e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4811  hypothetical protein  80.59 
 
 
170 aa  238  4e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.674359  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4897  hypothetical protein  80.59 
 
 
170 aa  238  4e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.912667  normal  0.0700179 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5198  hypothetical protein  80 
 
 
170 aa  237  5e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0142568  hitchhiker  0.000165751 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13700  transmembrane protein  70 
 
 
172 aa  220  7e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0470389 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3925  protein of unknown function DUF1469  61.83 
 
 
171 aa  147  9e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.962598  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0260  protein of unknown function DUF1469  57.14 
 
 
155 aa  129  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.864061  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0724  protein of unknown function DUF1469  47.66 
 
 
158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36060  Protein of unknown function (DUF1469)  49.61 
 
 
169 aa  110  6e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328772  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0512  protein of unknown function DUF1469  50 
 
 
175 aa  105  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0525  protein of unknown function DUF1469  43.94 
 
 
168 aa  85.9  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.822053  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25370  Protein of unknown function (DUF1469)  38.93 
 
 
155 aa  80.9  0.000000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0344  hypothetical protein  36.15 
 
 
139 aa  80.1  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0555  protein of unknown function DUF1469  38.21 
 
 
180 aa  74.7  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000647144 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4481  protein of unknown function DUF1469  34.53 
 
 
157 aa  72.4  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.105215 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4294  hypothetical protein  35.65 
 
 
248 aa  71.2  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.121888  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01420  Protein of unknown function (DUF1469)  33.56 
 
 
155 aa  70.9  0.000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0051  protein of unknown function DUF1469  33.58 
 
 
142 aa  69.3  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0561  protein of unknown function DUF1469  31.13 
 
 
142 aa  68.6  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0417  protein of unknown function DUF1469  35.92 
 
 
165 aa  67.4  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0343446  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12680  Protein of unknown function (DUF1469)  32.61 
 
 
160 aa  65.1  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0347  hypothetical protein  31.01 
 
 
140 aa  63.2  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0321  hypothetical protein  32.52 
 
 
163 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.202745  normal  0.194337 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2073  protein of unknown function DUF1469  39.67 
 
 
137 aa  62.4  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2340  protein of unknown function DUF1469  33.59 
 
 
157 aa  61.6  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0210  hypothetical protein  26.58 
 
 
156 aa  59.7  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0475  hypothetical protein  30.23 
 
 
157 aa  58.9  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1321  protein of unknown function DUF1469  30.25 
 
 
175 aa  56.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2992  hypothetical protein  31.39 
 
 
146 aa  56.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0131  hypothetical protein  30.89 
 
 
153 aa  55.8  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.241414  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4843  protein of unknown function DUF1469  38.75 
 
 
144 aa  55.5  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6022  hypothetical protein  32.06 
 
 
156 aa  55.1  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1772  hypothetical protein  32.88 
 
 
151 aa  54.3  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1759  hypothetical protein  33.59 
 
 
151 aa  53.9  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0234108 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0221  hypothetical protein  33.6 
 
 
202 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.253727 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34040  Protein of unknown function (DUF1469)  30.4 
 
 
140 aa  52  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2903  protein of unknown function DUF1469  30.95 
 
 
144 aa  51.2  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708128  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27570  Protein of unknown function (DUF1469)  34.43 
 
 
138 aa  50.4  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3084  protein of unknown function DUF1469  34.43 
 
 
138 aa  48.5  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0809  protein of unknown function DUF1469  31.5 
 
 
142 aa  48.1  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1591  hypothetical protein  36.61 
 
 
151 aa  46.2  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1006  hypothetical protein  31.82 
 
 
149 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0515851  hitchhiker  0.00247908 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0932  hypothetical protein  34.07 
 
 
133 aa  45.4  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2137  hypothetical protein  30.33 
 
 
133 aa  44.3  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.375802  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3353  protein of unknown function DUF1469  35 
 
 
145 aa  43.9  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6667  hypothetical protein  34.56 
 
 
193 aa  43.9  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126358  normal  0.676846 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2275  hypothetical protein  30.17 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4815  protein of unknown function DUF1469  37.25 
 
 
131 aa  43.5  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0178  hypothetical protein  29.75 
 
 
149 aa  41.6  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>