70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3353 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3353  protein of unknown function DUF1469  100 
 
 		 145 aa  273  6e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4481  protein of unknown function DUF1469  52.23 
 
 		 157 aa  154  6e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.105215 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1772  hypothetical protein  58.73 
 
 		 151 aa  140  6e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1759  hypothetical protein  57.72 
 
 		 151 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0234108 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2340  protein of unknown function DUF1469  48.91 
 
 		 157 aa  124  6e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34040  Protein of unknown function (DUF1469)  47.79 
 
 		 140 aa  113  6.9999999999999995e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2903  protein of unknown function DUF1469  55.65 
 
 		 144 aa  111  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0932  hypothetical protein  50 
 
 		 133 aa  111  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2275  hypothetical protein  58.87 
 
 		 134 aa  110  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2236  hypothetical protein  58.06 
 
 		 134 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2283  hypothetical protein  58.06 
 
 		 134 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.122746  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2137  hypothetical protein  51.97 
 
 		 133 aa  107  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.375802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27570  Protein of unknown function (DUF1469)  46.21 
 
 		 138 aa  101  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1993  protein of unknown function DUF1469  52.38 
 
 		 137 aa  95.9  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.122307  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4774  protein of unknown function DUF1469  50.83 
 
 		 151 aa  93.6  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.487422  normal  0.301166 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6344  hypothetical protein  53.85 
 
 		 133 aa  89.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.443827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0334  hypothetical protein  55.46 
 
 		 134 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3512  protein of unknown function DUF1469  51.2 
 
 		 132 aa  83.6  8e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.377984 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6549  protein of unknown function DUF1469  47.86 
 
 		 140 aa  83.6  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0142295  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3084  protein of unknown function DUF1469  41.54 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2073  protein of unknown function DUF1469  43.65 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4218  protein of unknown function DUF1469  47.29 
 
 		 132 aa  80.1  0.000000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01420  Protein of unknown function (DUF1469)  44.74 
 
 		 155 aa  77.8  0.00000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0809  protein of unknown function DUF1469  41.84 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0051  protein of unknown function DUF1469  40.57 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0561  protein of unknown function DUF1469  40.57 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0555  protein of unknown function DUF1469  45.87 
 
 		 180 aa  70.1  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000647144 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0724  protein of unknown function DUF1469  35.54 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0347  hypothetical protein  40.57 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2992  hypothetical protein  38.41 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6022  hypothetical protein  32.12 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0417  protein of unknown function DUF1469  41.67 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0343446  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1321  protein of unknown function DUF1469  42.06 
 
 		 175 aa  64.7  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1591  hypothetical protein  36.43 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25370  Protein of unknown function (DUF1469)  35.16 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1342  hypothetical protein  38.89 
 
 		 308 aa  60.5  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.255297  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1814  protein of unknown function DUF1469  50.39 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000011426  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3560  hypothetical protein  35.77 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.462126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2383  putative integral membrane protein  38.1 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0168516  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1045  hypothetical protein  38.1 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0593921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11370  Protein of unknown function (DUF1469)  57.72 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4843  protein of unknown function DUF1469  45.6 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0258139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13700  transmembrane protein  31.01 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0470389 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06670  Protein of unknown function (DUF1469)  33.79 
 
 		 307 aa  54.3  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5428  hypothetical protein  36 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0475  hypothetical protein  43.52 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0178  hypothetical protein  29.92 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1006  hypothetical protein  38.26 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0515851  hitchhiker  0.00247908 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0131  hypothetical protein  35.43 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.241414  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1378  hypothetical protein  32.81 
 
 		 169 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0194818  normal  0.100632 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0221  hypothetical protein  34.78 
 
 		 202 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.253727 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1384  protein of unknown function DUF1469  36.57 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000799445  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1891  hypothetical protein  35.43 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.373064  normal  0.485358 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0210  hypothetical protein  41 
 
 		 156 aa  48.9  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34600  hypothetical protein  34.43 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0344  hypothetical protein  30.58 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36060  Protein of unknown function (DUF1469)  30.89 
 
 		 169 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328772  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0260  protein of unknown function DUF1469  30.72 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.864061  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1378  protein of unknown function DUF1469  37.04 
 
 		 284 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000017645 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0321  hypothetical protein  32.31 
 
 		 163 aa  47  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.202745  normal  0.194337 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4811  hypothetical protein  35.96 
 
 		 170 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.674359  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1604  protein of unknown function DUF1469  33.06 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5198  hypothetical protein  35.96 
 
 		 170 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0142568  hitchhiker  0.000165751 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4897  hypothetical protein  35.96 
 
 		 170 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.912667  normal  0.0700179 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4179  hypothetical protein  35.38 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.865834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3054  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0916548  normal  0.287496 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3925  protein of unknown function DUF1469  27.46 
 
 		 171 aa  44.7  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.962598  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4815  protein of unknown function DUF1469  38.46 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4294  hypothetical protein  30.65 
 
 		 248 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.121888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0525  protein of unknown function DUF1469  39.62 
 
 		 168 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.822053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>