40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4843 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4843  protein of unknown function DUF1469  100 
 
 
135 aa  257  4e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0258139  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1759  hypothetical protein  51.49 
 
 
151 aa  100  8e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0234108 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1772  hypothetical protein  49.28 
 
 
151 aa  98.6  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4481  protein of unknown function DUF1469  44 
 
 
157 aa  91.7  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.105215 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2340  protein of unknown function DUF1469  37.5 
 
 
157 aa  84  6e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2275  hypothetical protein  41.67 
 
 
134 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2283  hypothetical protein  40.91 
 
 
134 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.122746  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2236  hypothetical protein  40.91 
 
 
134 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861722  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34040  Protein of unknown function (DUF1469)  39.17 
 
 
140 aa  75.5  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0334  hypothetical protein  40 
 
 
134 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3353  protein of unknown function DUF1469  45.6 
 
 
145 aa  67  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0932  hypothetical protein  35.38 
 
 
133 aa  66.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27570  Protein of unknown function (DUF1469)  38.02 
 
 
138 aa  66.2  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2073  protein of unknown function DUF1469  40.88 
 
 
137 aa  64.7  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2137  hypothetical protein  40 
 
 
133 aa  64.3  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.375802  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0809  protein of unknown function DUF1469  33.88 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2903  protein of unknown function DUF1469  36.36 
 
 
144 aa  60.5  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708128  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2992  hypothetical protein  35.2 
 
 
146 aa  60.1  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4774  protein of unknown function DUF1469  43.18 
 
 
151 aa  59.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.487422  normal  0.301166 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3512  protein of unknown function DUF1469  40.16 
 
 
132 aa  57.8  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.377984 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01420  Protein of unknown function (DUF1469)  31.15 
 
 
155 aa  56.6  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6344  hypothetical protein  48.31 
 
 
133 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.443827  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0561  protein of unknown function DUF1469  31.36 
 
 
142 aa  54.3  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0051  protein of unknown function DUF1469  31.36 
 
 
142 aa  54.7  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0347  hypothetical protein  30.51 
 
 
140 aa  51.6  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3084  protein of unknown function DUF1469  28.81 
 
 
138 aa  51.6  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1321  protein of unknown function DUF1469  35.14 
 
 
175 aa  50.4  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6549  protein of unknown function DUF1469  38.05 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0142295  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0417  protein of unknown function DUF1469  31.06 
 
 
165 aa  48.5  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0343446  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1993  protein of unknown function DUF1469  40.32 
 
 
137 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.122307  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6022  hypothetical protein  28.79 
 
 
156 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4179  hypothetical protein  33.08 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.865834  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0555  protein of unknown function DUF1469  31.71 
 
 
180 aa  46.2  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000647144 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0131  hypothetical protein  29.82 
 
 
153 aa  45.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.241414  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3560  hypothetical protein  40.16 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.462126  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1342  hypothetical protein  39.68 
 
 
308 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.255297  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1006  hypothetical protein  40.45 
 
 
149 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0515851  hitchhiker  0.00247908 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4218  protein of unknown function DUF1469  42.03 
 
 
132 aa  41.6  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0724  protein of unknown function DUF1469  27.72 
 
 
158 aa  41.6  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1378  protein of unknown function DUF1469  34.95 
 
 
284 aa  40.8  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000017645 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>