27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1342 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1342  hypothetical protein  100 
 
 
308 aa  598  1e-170  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.255297  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1378  protein of unknown function DUF1469  65.85 
 
 
284 aa  263  3e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000017645 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06670  Protein of unknown function (DUF1469)  37.63 
 
 
307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2903  protein of unknown function DUF1469  43.22 
 
 
144 aa  70.9  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708128  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1759  hypothetical protein  36.13 
 
 
151 aa  70.1  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0234108 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34040  Protein of unknown function (DUF1469)  37.38 
 
 
140 aa  68.6  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1772  hypothetical protein  34.45 
 
 
151 aa  64.7  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4481  protein of unknown function DUF1469  33.9 
 
 
157 aa  64.3  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.105215 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25370  Protein of unknown function (DUF1469)  40 
 
 
155 aa  63.5  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1993  protein of unknown function DUF1469  41.32 
 
 
137 aa  62.4  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.122307  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2137  hypothetical protein  37.38 
 
 
133 aa  61.2  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.375802  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3353  protein of unknown function DUF1469  38.89 
 
 
145 aa  59.7  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4218  protein of unknown function DUF1469  36.13 
 
 
132 aa  55.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4774  protein of unknown function DUF1469  34.33 
 
 
151 aa  55.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.487422  normal  0.301166 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2340  protein of unknown function DUF1469  33.68 
 
 
157 aa  53.9  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0932  hypothetical protein  34.88 
 
 
133 aa  51.6  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3512  protein of unknown function DUF1469  38.52 
 
 
132 aa  49.7  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.377984 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6022  hypothetical protein  31.4 
 
 
156 aa  49.7  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27570  Protein of unknown function (DUF1469)  33.96 
 
 
138 aa  48.9  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4294  hypothetical protein  29.6 
 
 
248 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.121888  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1591  hypothetical protein  37.19 
 
 
151 aa  48.1  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2283  hypothetical protein  33.96 
 
 
134 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.122746  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2236  hypothetical protein  33.96 
 
 
134 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861722  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2275  hypothetical protein  33.96 
 
 
134 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6549  protein of unknown function DUF1469  34.62 
 
 
140 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0142295  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2073  protein of unknown function DUF1469  37.5 
 
 
137 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0178  hypothetical protein  32.35 
 
 
149 aa  43.9  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>