61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1772 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1772  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  283  4e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1759  hypothetical protein  88.67 
 
 
151 aa  249  8.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0234108 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4481  protein of unknown function DUF1469  56.39 
 
 
157 aa  139  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.105215 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2340  protein of unknown function DUF1469  50.39 
 
 
157 aa  121  4e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6344  hypothetical protein  66.95 
 
 
133 aa  110  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.443827  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2137  hypothetical protein  56.1 
 
 
133 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.375802  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27570  Protein of unknown function (DUF1469)  53.97 
 
 
138 aa  106  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3353  protein of unknown function DUF1469  58.73 
 
 
145 aa  105  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4774  protein of unknown function DUF1469  54.03 
 
 
151 aa  102  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.487422  normal  0.301166 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2275  hypothetical protein  48.8 
 
 
134 aa  100  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2236  hypothetical protein  48.8 
 
 
134 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861722  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0932  hypothetical protein  49.21 
 
 
133 aa  100  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2283  hypothetical protein  48.8 
 
 
134 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.122746  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0334  hypothetical protein  49.62 
 
 
134 aa  94  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34040  Protein of unknown function (DUF1469)  40.15 
 
 
140 aa  87.8  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2903  protein of unknown function DUF1469  48.78 
 
 
144 aa  87.4  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708128  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6549  protein of unknown function DUF1469  46.03 
 
 
140 aa  83.6  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0142295  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2073  protein of unknown function DUF1469  50.42 
 
 
137 aa  81.3  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1993  protein of unknown function DUF1469  54.92 
 
 
137 aa  80.5  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.122307  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3084  protein of unknown function DUF1469  38.84 
 
 
138 aa  79.7  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4218  protein of unknown function DUF1469  46.34 
 
 
132 aa  77.8  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3512  protein of unknown function DUF1469  46.85 
 
 
132 aa  74.3  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.377984 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2992  hypothetical protein  40 
 
 
146 aa  73.2  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0809  protein of unknown function DUF1469  43.1 
 
 
142 aa  71.6  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0321  hypothetical protein  38.1 
 
 
163 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.202745  normal  0.194337 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1814  protein of unknown function DUF1469  53.72 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000011426  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01420  Protein of unknown function (DUF1469)  41.28 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0555  protein of unknown function DUF1469  40 
 
 
180 aa  63.5  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000647144 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13700  transmembrane protein  33.57 
 
 
172 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0470389 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0724  protein of unknown function DUF1469  35.29 
 
 
158 aa  62.8  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4294  hypothetical protein  39.84 
 
 
248 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.121888  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6022  hypothetical protein  33.59 
 
 
156 aa  60.5  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4843  protein of unknown function DUF1469  49.28 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0258139  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0561  protein of unknown function DUF1469  35.58 
 
 
142 aa  57.8  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0051  protein of unknown function DUF1469  35.58 
 
 
142 aa  57.8  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1342  hypothetical protein  34.45 
 
 
308 aa  57.8  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.255297  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0221  hypothetical protein  43.44 
 
 
202 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.253727 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5428  hypothetical protein  32.17 
 
 
175 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0417  protein of unknown function DUF1469  37.5 
 
 
165 aa  56.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0343446  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1378  hypothetical protein  32.88 
 
 
169 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0194818  normal  0.100632 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25370  Protein of unknown function (DUF1469)  39.09 
 
 
155 aa  53.9  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06670  Protein of unknown function (DUF1469)  39.22 
 
 
307 aa  53.1  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0347  hypothetical protein  34.21 
 
 
140 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36060  Protein of unknown function (DUF1469)  32.5 
 
 
169 aa  52.4  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328772  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0178  hypothetical protein  33.85 
 
 
149 aa  52.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11370  Protein of unknown function (DUF1469)  50.39 
 
 
137 aa  51.2  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0344  hypothetical protein  30.58 
 
 
139 aa  51.2  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3054  hypothetical protein  33.63 
 
 
145 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0916548  normal  0.287496 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3925  protein of unknown function DUF1469  34.69 
 
 
171 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.962598  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1591  hypothetical protein  32.88 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1378  protein of unknown function DUF1469  31.03 
 
 
284 aa  47.4  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000017645 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1321  protein of unknown function DUF1469  33.33 
 
 
175 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0525  protein of unknown function DUF1469  39.83 
 
 
168 aa  45.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.822053  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5198  hypothetical protein  34.83 
 
 
170 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0142568  hitchhiker  0.000165751 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4897  hypothetical protein  34.83 
 
 
170 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.912667  normal  0.0700179 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4811  hypothetical protein  34.83 
 
 
170 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.674359  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4179  hypothetical protein  38.76 
 
 
136 aa  43.9  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.865834  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1384  protein of unknown function DUF1469  39.47 
 
 
148 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000799445  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1891  hypothetical protein  39.17 
 
 
133 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.373064  normal  0.485358 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3560  hypothetical protein  28.36 
 
 
134 aa  41.6  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.462126  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2210  hypothetical protein  37.21 
 
 
132 aa  40.8  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.554398  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>