52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1321 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1321  protein of unknown function DUF1469  100 
 
 		 175 aa  351  2e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0347  hypothetical protein  50 
 
 		 140 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2992  hypothetical protein  57.52 
 
 		 146 aa  114  5e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0051  protein of unknown function DUF1469  47.29 
 
 		 142 aa  113  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0561  protein of unknown function DUF1469  47.29 
 
 		 142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01420  Protein of unknown function (DUF1469)  46.04 
 
 		 155 aa  111  6e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0555  protein of unknown function DUF1469  47.2 
 
 		 180 aa  107  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000647144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6022  hypothetical protein  41.13 
 
 		 156 aa  96.7  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0809  protein of unknown function DUF1469  44.07 
 
 		 142 aa  91.3  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0221  hypothetical protein  43.38 
 
 		 202 aa  90.1  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.253727 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4481  protein of unknown function DUF1469  40.34 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.105215 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6667  hypothetical protein  39.77 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126358  normal  0.676846 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0417  protein of unknown function DUF1469  36.29 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0343446  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2073  protein of unknown function DUF1469  36.97 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34600  hypothetical protein  38.84 
 
 		 120 aa  63.5  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34040  Protein of unknown function (DUF1469)  35.71 
 
 		 140 aa  63.5  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0344  hypothetical protein  32.03 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4774  protein of unknown function DUF1469  38.81 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.487422  normal  0.301166 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4232  protein of unknown function DUF1469  50 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4294  hypothetical protein  35.9 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.121888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2275  hypothetical protein  36.97 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2903  protein of unknown function DUF1469  36.13 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0321  hypothetical protein  34.88 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.202745  normal  0.194337 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0178  hypothetical protein  31.78 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2340  protein of unknown function DUF1469  32.21 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2236  hypothetical protein  36.13 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2283  hypothetical protein  36.13 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.122746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1591  hypothetical protein  30.71 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25370  Protein of unknown function (DUF1469)  31.2 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0724  protein of unknown function DUF1469  29.27 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0525  protein of unknown function DUF1469  36.99 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.822053  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1378  hypothetical protein  30.25 
 
 		 169 aa  51.6  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0194818  normal  0.100632 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27570  Protein of unknown function (DUF1469)  31.75 
 
 		 138 aa  50.4  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3353  protein of unknown function DUF1469  42.06 
 
 		 145 aa  50.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36060  Protein of unknown function (DUF1469)  30.58 
 
 		 169 aa  49.7  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328772  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0932  hypothetical protein  33.9 
 
 		 133 aa  49.3  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1759  hypothetical protein  34.23 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0234108 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5428  hypothetical protein  29.84 
 
 		 175 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2383  putative integral membrane protein  31.58 
 
 		 133 aa  48.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0168516  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1045  hypothetical protein  31.58 
 
 		 133 aa  48.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0593921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13700  transmembrane protein  27.73 
 
 		 172 aa  47  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0470389 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0210  hypothetical protein  34.21 
 
 		 156 aa  47.4  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3084  protein of unknown function DUF1469  32.17 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1772  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0334  hypothetical protein  37.72 
 
 		 134 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2210  hypothetical protein  32.77 
 
 		 132 aa  42.7  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.554398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1891  hypothetical protein  32.2 
 
 		 133 aa  42.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.373064  normal  0.485358 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0512  protein of unknown function DUF1469  30.77 
 
 		 175 aa  41.6  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1006  hypothetical protein  34 
 
 		 149 aa  41.2  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0515851  hitchhiker  0.00247908 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0961  hypothetical protein  46.94 
 
 		 150 aa  41.2  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1022  protein of unknown function DUF1469  46.94 
 
 		 150 aa  41.2  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1019  protein of unknown function DUF1469  46.94 
 
 		 150 aa  41.2  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00635959  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>