52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0334 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0334  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  259  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2236  hypothetical protein  67.5 
 
 
134 aa  135  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2283  hypothetical protein  67.5 
 
 
134 aa  135  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.122746  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2275  hypothetical protein  66.67 
 
 
134 aa  134  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1772  hypothetical protein  49.62 
 
 
151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1759  hypothetical protein  47.52 
 
 
151 aa  118  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0234108 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4481  protein of unknown function DUF1469  48.76 
 
 
157 aa  112  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.105215 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2340  protein of unknown function DUF1469  46.77 
 
 
157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3353  protein of unknown function DUF1469  55.46 
 
 
145 aa  96.7  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27570  Protein of unknown function (DUF1469)  48.78 
 
 
138 aa  94  6e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34040  Protein of unknown function (DUF1469)  42.86 
 
 
140 aa  90.5  6e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0932  hypothetical protein  43.41 
 
 
133 aa  89  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3084  protein of unknown function DUF1469  37.98 
 
 
138 aa  84  7e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2073  protein of unknown function DUF1469  44.72 
 
 
137 aa  83.2  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2137  hypothetical protein  41.41 
 
 
133 aa  82.8  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.375802  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2903  protein of unknown function DUF1469  40.34 
 
 
144 aa  79  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708128  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6344  hypothetical protein  44.72 
 
 
133 aa  76.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.443827  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4774  protein of unknown function DUF1469  46.22 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.487422  normal  0.301166 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6549  protein of unknown function DUF1469  38.41 
 
 
140 aa  70.5  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0142295  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3512  protein of unknown function DUF1469  40.8 
 
 
132 aa  67.4  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.377984 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0809  protein of unknown function DUF1469  37.4 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4218  protein of unknown function DUF1469  39.5 
 
 
132 aa  66.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6022  hypothetical protein  36.89 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1993  protein of unknown function DUF1469  45.83 
 
 
137 aa  65.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.122307  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2992  hypothetical protein  36.57 
 
 
146 aa  64.7  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0417  protein of unknown function DUF1469  34.88 
 
 
165 aa  63.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0343446  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0321  hypothetical protein  33.85 
 
 
163 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.202745  normal  0.194337 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01420  Protein of unknown function (DUF1469)  34.96 
 
 
155 aa  61.2  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1321  protein of unknown function DUF1469  37.72 
 
 
175 aa  60.5  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0724  protein of unknown function DUF1469  32.43 
 
 
158 aa  60.1  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4843  protein of unknown function DUF1469  40 
 
 
135 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0258139  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0561  protein of unknown function DUF1469  33.96 
 
 
142 aa  55.1  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0051  protein of unknown function DUF1469  33.96 
 
 
142 aa  54.7  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0555  protein of unknown function DUF1469  28.36 
 
 
180 aa  52.8  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000647144 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4294  hypothetical protein  31.15 
 
 
248 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.121888  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0347  hypothetical protein  30.33 
 
 
140 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36060  Protein of unknown function (DUF1469)  30.89 
 
 
169 aa  50.1  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328772  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0131  hypothetical protein  31.03 
 
 
153 aa  48.9  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.241414  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25370  Protein of unknown function (DUF1469)  28.18 
 
 
155 aa  48.1  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1384  protein of unknown function DUF1469  37.39 
 
 
148 aa  47.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000799445  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0221  hypothetical protein  33.9 
 
 
202 aa  47.8  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.253727 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1814  protein of unknown function DUF1469  46.4 
 
 
142 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000011426  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0178  hypothetical protein  26.98 
 
 
149 aa  47.4  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1475  protein of unknown function DUF1469  41.79 
 
 
129 aa  45.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00110957  normal  0.391002 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0525  protein of unknown function DUF1469  37.6 
 
 
168 aa  45.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.822053  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0475  hypothetical protein  35.94 
 
 
157 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4843  protein of unknown function DUF1469  37.8 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4179  hypothetical protein  31.09 
 
 
136 aa  41.2  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.865834  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12680  Protein of unknown function (DUF1469)  37.61 
 
 
160 aa  41.2  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3925  protein of unknown function DUF1469  29.32 
 
 
171 aa  40.4  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.962598  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13700  transmembrane protein  28.46 
 
 
172 aa  40.4  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0470389 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5198  hypothetical protein  34.19 
 
 
170 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0142568  hitchhiker  0.000165751 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>