56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3084 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_3084  protein of unknown function DUF1469  100 
 
 
138 aa  268  1e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34040  Protein of unknown function (DUF1469)  48.46 
 
 
140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4481  protein of unknown function DUF1469  37.4 
 
 
157 aa  92  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.105215 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2340  protein of unknown function DUF1469  39.67 
 
 
157 aa  85.5  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1772  hypothetical protein  38.84 
 
 
151 aa  79.7  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1759  hypothetical protein  40.5 
 
 
151 aa  77  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0234108 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2903  protein of unknown function DUF1469  44.26 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708128  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0932  hypothetical protein  34.35 
 
 
133 aa  73.9  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3512  protein of unknown function DUF1469  40 
 
 
132 aa  72.8  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.377984 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3353  protein of unknown function DUF1469  42.19 
 
 
145 aa  67  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0334  hypothetical protein  37.98 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4774  protein of unknown function DUF1469  40.94 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.487422  normal  0.301166 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4294  hypothetical protein  42.54 
 
 
248 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.121888  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2137  hypothetical protein  38.66 
 
 
133 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.375802  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2275  hypothetical protein  33.07 
 
 
134 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2283  hypothetical protein  33.07 
 
 
134 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.122746  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2236  hypothetical protein  33.07 
 
 
134 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861722  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0344  hypothetical protein  35.59 
 
 
139 aa  58.2  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27570  Protein of unknown function (DUF1469)  33.06 
 
 
138 aa  57.8  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0555  protein of unknown function DUF1469  34.68 
 
 
180 aa  57.4  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000647144 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4179  hypothetical protein  36.8 
 
 
136 aa  57  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.865834  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4218  protein of unknown function DUF1469  33.59 
 
 
132 aa  56.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0321  hypothetical protein  36.29 
 
 
163 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.202745  normal  0.194337 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1591  hypothetical protein  30.14 
 
 
151 aa  55.5  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6344  hypothetical protein  47.46 
 
 
133 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.443827  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25370  Protein of unknown function (DUF1469)  33.02 
 
 
155 aa  54.3  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0417  protein of unknown function DUF1469  43.37 
 
 
165 aa  54.3  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0343446  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6022  hypothetical protein  33.59 
 
 
156 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2073  protein of unknown function DUF1469  34.85 
 
 
137 aa  51.2  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0178  hypothetical protein  31.06 
 
 
149 aa  50.4  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36060  Protein of unknown function (DUF1469)  32.54 
 
 
169 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328772  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6549  protein of unknown function DUF1469  36.03 
 
 
140 aa  47.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0142295  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1993  protein of unknown function DUF1469  36.22 
 
 
137 aa  47  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.122307  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4811  hypothetical protein  40.35 
 
 
170 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.674359  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3925  protein of unknown function DUF1469  42.19 
 
 
171 aa  46.6  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.962598  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0724  protein of unknown function DUF1469  33.02 
 
 
158 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4897  hypothetical protein  40.35 
 
 
170 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.912667  normal  0.0700179 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1321  protein of unknown function DUF1469  32.17 
 
 
175 aa  46.2  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1378  hypothetical protein  40.35 
 
 
169 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0194818  normal  0.100632 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5198  hypothetical protein  40.35 
 
 
170 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0142568  hitchhiker  0.000165751 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5428  hypothetical protein  30.51 
 
 
175 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0512  protein of unknown function DUF1469  34.35 
 
 
175 aa  45.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6820  hypothetical protein  34.13 
 
 
131 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0809  protein of unknown function DUF1469  36.29 
 
 
142 aa  45.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34600  hypothetical protein  25.86 
 
 
120 aa  44.7  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01420  Protein of unknown function (DUF1469)  29.75 
 
 
155 aa  43.9  0.0007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0347  hypothetical protein  32.54 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1006  hypothetical protein  31.34 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0515851  hitchhiker  0.00247908 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4843  protein of unknown function DUF1469  35.53 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7553  protein of unknown function DUF1469  33.33 
 
 
131 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0520584  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0221  hypothetical protein  30.25 
 
 
202 aa  40.4  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.253727 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1384  protein of unknown function DUF1469  30.7 
 
 
148 aa  40.8  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000799445  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0051  protein of unknown function DUF1469  28.21 
 
 
142 aa  40.4  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0475  hypothetical protein  33.08 
 
 
157 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0561  protein of unknown function DUF1469  28.21 
 
 
142 aa  40  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13700  transmembrane protein  28.85 
 
 
172 aa  40  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0470389 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>