28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6820 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6820  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  250  3e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7553  protein of unknown function DUF1469  94.66 
 
 		 131 aa  201  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0520584  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1689  protein of unknown function DUF1469  70.73 
 
 		 138 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1831  protein of unknown function DUF1469  69.11 
 
 		 135 aa  160  7e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.371829 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1552  hypothetical protein  69.11 
 
 		 140 aa  160  7e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1483  hypothetical protein  68.46 
 
 		 145 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000255218 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4815  protein of unknown function DUF1469  57.36 
 
 		 131 aa  137  6e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1300  hypothetical protein  41.46 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.726598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2210  hypothetical protein  40.16 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.554398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1591  hypothetical protein  36.84 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3560  hypothetical protein  33.58 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.462126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3084  protein of unknown function DUF1469  34.13 
 
 		 138 aa  57  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7599  protein of unknown function DUF1469  37.25 
 
 		 121 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1045  hypothetical protein  38.89 
 
 		 133 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0593921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2383  putative integral membrane protein  38.89 
 
 		 133 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0168516  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4179  hypothetical protein  36 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.865834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3869  hypothetical protein  32.31 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.748627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5621  protein of unknown function DUF1469  30.6 
 
 		 138 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.182455 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1759  hypothetical protein  33.9 
 
 		 151 aa  44.7  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0234108 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1772  hypothetical protein  33.88 
 
 		 151 aa  44.7  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1438  protein of unknown function DUF1469  30.23 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.157465  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0809  protein of unknown function DUF1469  30.7 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34600  hypothetical protein  27.73 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0344  hypothetical protein  29.01 
 
 		 139 aa  41.6  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4599  hypothetical protein  28.68 
 
 		 130 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34040  Protein of unknown function (DUF1469)  29.46 
 
 		 140 aa  41.6  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1247  hypothetical protein  31.5 
 
 		 129 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.391441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3900  putative nutrient deprivation-induced protein  30.95 
 
 		 139 aa  40.4  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0615251  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>