68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_34040 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_34040  Protein of unknown function (DUF1469)  100 
 
 		 140 aa  264  2.9999999999999995e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2340  protein of unknown function DUF1469  51.45 
 
 		 157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3084  protein of unknown function DUF1469  48.46 
 
 		 138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2903  protein of unknown function DUF1469  54.47 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4481  protein of unknown function DUF1469  39.02 
 
 		 157 aa  91.7  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.105215 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3353  protein of unknown function DUF1469  47.79 
 
 		 145 aa  91.3  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1759  hypothetical protein  43.33 
 
 		 151 aa  89  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0234108 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1772  hypothetical protein  40.15 
 
 		 151 aa  87.8  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3512  protein of unknown function DUF1469  50.79 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.377984 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4774  protein of unknown function DUF1469  44.63 
 
 		 151 aa  80.5  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.487422  normal  0.301166 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27570  Protein of unknown function (DUF1469)  36.5 
 
 		 138 aa  75.9  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0932  hypothetical protein  38.21 
 
 		 133 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2275  hypothetical protein  39.23 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2283  hypothetical protein  39.23 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.122746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2236  hypothetical protein  39.23 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861722  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4218  protein of unknown function DUF1469  43.7 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2137  hypothetical protein  38.71 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.375802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2073  protein of unknown function DUF1469  39.55 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6549  protein of unknown function DUF1469  36.09 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0142295  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0334  hypothetical protein  42.15 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0178  hypothetical protein  34.93 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1321  protein of unknown function DUF1469  35.71 
 
 		 175 aa  63.5  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6344  hypothetical protein  40.31 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.443827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1993  protein of unknown function DUF1469  40.83 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.122307  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0809  protein of unknown function DUF1469  38.93 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1591  hypothetical protein  34.97 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25370  Protein of unknown function (DUF1469)  40.91 
 
 		 155 aa  60.1  0.000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0417  protein of unknown function DUF1469  36.96 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0343446  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06670  Protein of unknown function (DUF1469)  31.58 
 
 		 307 aa  57  0.00000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5621  protein of unknown function DUF1469  35.61 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.182455 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2992  hypothetical protein  31.71 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0724  protein of unknown function DUF1469  30.43 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01420  Protein of unknown function (DUF1469)  36.8 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1814  protein of unknown function DUF1469  45.31 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000011426  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6022  hypothetical protein  34.13 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0321  hypothetical protein  30.4 
 
 		 163 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.202745  normal  0.194337 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36060  Protein of unknown function (DUF1469)  29.37 
 
 		 169 aa  52.4  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328772  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4294  hypothetical protein  35.94 
 
 		 248 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.121888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1342  hypothetical protein  37.38 
 
 		 308 aa  52  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.255297  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0344  hypothetical protein  37.93 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4843  protein of unknown function DUF1469  39.76 
 
 		 144 aa  51.6  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1378  protein of unknown function DUF1469  39.25 
 
 		 284 aa  51.2  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000017645 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12680  Protein of unknown function (DUF1469)  34.35 
 
 		 160 aa  51.2  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11370  Protein of unknown function (DUF1469)  43.65 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0561  protein of unknown function DUF1469  33.96 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34600  hypothetical protein  33.6 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0051  protein of unknown function DUF1469  33.96 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4843  protein of unknown function DUF1469  39.17 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0258139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0475  hypothetical protein  42.45 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1689  protein of unknown function DUF1469  32.5 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5428  hypothetical protein  31.62 
 
 		 175 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0555  protein of unknown function DUF1469  33.59 
 
 		 180 aa  47.4  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000647144 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1378  hypothetical protein  30.4 
 
 		 169 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0194818  normal  0.100632 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5198  hypothetical protein  34.38 
 
 		 170 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0142568  hitchhiker  0.000165751 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13700  transmembrane protein  28.91 
 
 		 172 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0470389 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4897  hypothetical protein  35.42 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.912667  normal  0.0700179 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3900  putative nutrient deprivation-induced protein  37.1 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0615251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1552  hypothetical protein  30.83 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4811  hypothetical protein  35.42 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.674359  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1831  protein of unknown function DUF1469  30.83 
 
 		 135 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.371829 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4179  hypothetical protein  33.33 
 
 		 136 aa  44.3  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.865834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0347  hypothetical protein  31.82 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0210  hypothetical protein  37.38 
 
 		 156 aa  43.5  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0131  hypothetical protein  35.45 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.241414  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5260  nutrient deprivation-induced protein  30.37 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2383  putative integral membrane protein  32.12 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0168516  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1045  hypothetical protein  32.12 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0593921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3560  hypothetical protein  30.43 
 
 		 134 aa  40  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.462126  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>