62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2383 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2383  putative integral membrane protein  100 
 
 		 133 aa  249  1e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0168516  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1045  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  249  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0593921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1891  hypothetical protein  84.96 
 
 		 133 aa  172  9e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.373064  normal  0.485358 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1591  hypothetical protein  40.46 
 
 		 151 aa  77  0.00000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2210  hypothetical protein  43.8 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.554398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2992  hypothetical protein  36.51 
 
 		 146 aa  67.4  0.00000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4481  protein of unknown function DUF1469  33.08 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.105215 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4815  protein of unknown function DUF1469  35.71 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34600  hypothetical protein  33.62 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1552  hypothetical protein  35.59 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1831  protein of unknown function DUF1469  35.59 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.371829 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1689  protein of unknown function DUF1469  34.45 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3560  hypothetical protein  35.56 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.462126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27570  Protein of unknown function (DUF1469)  36.51 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3142  hypothetical protein  47.97 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0561  protein of unknown function DUF1469  32.71 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5621  protein of unknown function DUF1469  34.33 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.182455 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0347  hypothetical protein  31.78 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0555  protein of unknown function DUF1469  34.45 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000647144 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2073  protein of unknown function DUF1469  41.8 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6022  hypothetical protein  31.09 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0051  protein of unknown function DUF1469  32.71 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1438  protein of unknown function DUF1469  38.89 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.157465  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0809  protein of unknown function DUF1469  29.75 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1321  protein of unknown function DUF1469  31.58 
 
 		 175 aa  58.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5260  nutrient deprivation-induced protein  33.33 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3353  protein of unknown function DUF1469  38.4 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0407  putative integral membrane protein  32.77 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.131115 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1772  hypothetical protein  36.97 
 
 		 151 aa  53.5  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34040  Protein of unknown function (DUF1469)  32.12 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01420  Protein of unknown function (DUF1469)  29.03 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0221  hypothetical protein  36.89 
 
 		 202 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.253727 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7553  protein of unknown function DUF1469  40.48 
 
 		 131 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0520584  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4599  hypothetical protein  30.95 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0724  protein of unknown function DUF1469  29.09 
 
 		 158 aa  50.8  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3869  hypothetical protein  33.33 
 
 		 130 aa  50.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.748627  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2137  hypothetical protein  37.6 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.375802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3084  protein of unknown function DUF1469  33.33 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1483  hypothetical protein  36.07 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000255218 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1384  protein of unknown function DUF1469  38.1 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000799445  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3900  putative nutrient deprivation-induced protein  30.6 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0615251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4179  hypothetical protein  32.58 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.865834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6820  hypothetical protein  40.16 
 
 		 131 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1759  hypothetical protein  35.29 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0234108 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2275  hypothetical protein  32.52 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2340  protein of unknown function DUF1469  29.85 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2283  hypothetical protein  32.52 
 
 		 134 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.122746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2236  hypothetical protein  32.52 
 
 		 134 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861722  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0178  hypothetical protein  29.6 
 
 		 149 aa  47.4  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0932  hypothetical protein  35.59 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1247  hypothetical protein  30.77 
 
 		 129 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.391441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1378  hypothetical protein  29.92 
 
 		 169 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0194818  normal  0.100632 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3054  hypothetical protein  38.05 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0916548  normal  0.287496 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36060  Protein of unknown function (DUF1469)  32.98 
 
 		 169 aa  45.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328772  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4294  hypothetical protein  34.03 
 
 		 248 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.121888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5428  hypothetical protein  32 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2903  protein of unknown function DUF1469  39.66 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708128  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3925  protein of unknown function DUF1469  27.73 
 
 		 171 aa  42  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.962598  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0417  protein of unknown function DUF1469  32.23 
 
 		 165 aa  41.2  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0343446  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12680  Protein of unknown function (DUF1469)  33.33 
 
 		 160 aa  40.8  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6667  hypothetical protein  36.29 
 
 		 193 aa  40.4  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126358  normal  0.676846 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25370  Protein of unknown function (DUF1469)  29.41 
 
 		 155 aa  40  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>