42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3142 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3142  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  256  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1591  hypothetical protein  46.1 
 
 		 151 aa  95.1  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2383  putative integral membrane protein  47.97 
 
 		 133 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0168516  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1045  hypothetical protein  47.97 
 
 		 133 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0593921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4599  hypothetical protein  33.87 
 
 		 130 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1891  hypothetical protein  40.65 
 
 		 133 aa  71.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.373064  normal  0.485358 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4815  protein of unknown function DUF1469  34.68 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34600  hypothetical protein  32.2 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1689  protein of unknown function DUF1469  36.89 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5621  protein of unknown function DUF1469  34.06 
 
 		 138 aa  67  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.182455 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1438  protein of unknown function DUF1469  38.71 
 
 		 130 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.157465  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1552  hypothetical protein  36.89 
 
 		 140 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1831  protein of unknown function DUF1469  36.89 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.371829 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3869  hypothetical protein  36.29 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.748627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3878  hypothetical protein  36.64 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.716332  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1247  hypothetical protein  35.88 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.391441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2210  hypothetical protein  39.06 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.554398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5260  nutrient deprivation-induced protein  33.82 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34040  Protein of unknown function (DUF1469)  37.9 
 
 		 140 aa  57  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3900  putative nutrient deprivation-induced protein  30.22 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0615251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3560  hypothetical protein  30.77 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.462126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1483  hypothetical protein  32.8 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000255218 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0809  protein of unknown function DUF1469  31.5 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1006  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0515851  hitchhiker  0.00247908 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2903  protein of unknown function DUF1469  35.59 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3084  protein of unknown function DUF1469  28.57 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27570  Protein of unknown function (DUF1469)  33.85 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4179  hypothetical protein  28.35 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.865834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2992  hypothetical protein  29.37 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1604  protein of unknown function DUF1469  38.46 
 
 		 151 aa  44.7  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0407  putative integral membrane protein  27.73 
 
 		 141 aa  44.7  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.131115 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1321  protein of unknown function DUF1469  30.28 
 
 		 175 aa  43.9  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6022  hypothetical protein  26.98 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2073  protein of unknown function DUF1469  36.29 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1384  protein of unknown function DUF1469  34.71 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000799445  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0221  hypothetical protein  35.09 
 
 		 202 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.253727 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2137  hypothetical protein  29.63 
 
 		 133 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.375802  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0555  protein of unknown function DUF1469  28.57 
 
 		 180 aa  41.2  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000647144 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0444  hypothetical protein  34.74 
 
 		 246 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4481  protein of unknown function DUF1469  29.75 
 
 		 157 aa  40.8  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.105215 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6820  hypothetical protein  33.88 
 
 		 131 aa  40.4  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6667  hypothetical protein  36.07 
 
 		 193 aa  40.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126358  normal  0.676846 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>