27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3878 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3878  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  257  4e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.716332  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3869  hypothetical protein  48.85 
 
 		 130 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.748627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4599  hypothetical protein  41.46 
 
 		 130 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1247  hypothetical protein  47.15 
 
 		 129 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.391441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1438  protein of unknown function DUF1469  43.51 
 
 		 130 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.157465  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2210  hypothetical protein  41.38 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.554398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1591  hypothetical protein  31.82 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3560  hypothetical protein  30.77 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.462126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2992  hypothetical protein  31.15 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4815  protein of unknown function DUF1469  30.23 
 
 		 131 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3142  hypothetical protein  36.64 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0347  hypothetical protein  33.07 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2340  protein of unknown function DUF1469  29.6 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0407  putative integral membrane protein  29.01 
 
 		 141 aa  44.3  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.131115 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0051  protein of unknown function DUF1469  33.33 
 
 		 142 aa  44.3  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4481  protein of unknown function DUF1469  31.2 
 
 		 157 aa  43.5  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.105215 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4294  hypothetical protein  31.62 
 
 		 248 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.121888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1759  hypothetical protein  31.75 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0234108 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1689  protein of unknown function DUF1469  30.17 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5260  nutrient deprivation-induced protein  27.94 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0561  protein of unknown function DUF1469  32.29 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4179  hypothetical protein  30.25 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.865834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1772  hypothetical protein  31.75 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1552  hypothetical protein  30.17 
 
 		 140 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1831  protein of unknown function DUF1469  30.17 
 
 		 135 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.371829 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0321  hypothetical protein  28.07 
 
 		 163 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.202745  normal  0.194337 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0417  protein of unknown function DUF1469  30.83 
 
 		 165 aa  40.8  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0343446  normal  0.125133 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>