53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0347 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0347  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  278  2e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0051  protein of unknown function DUF1469  80.43 
 
 
142 aa  223  9e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0561  protein of unknown function DUF1469  79.71 
 
 
142 aa  219  7e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0555  protein of unknown function DUF1469  63.49 
 
 
180 aa  153  9e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000647144 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01420  Protein of unknown function (DUF1469)  51.54 
 
 
155 aa  138  3e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1321  protein of unknown function DUF1469  50 
 
 
175 aa  127  6e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0809  protein of unknown function DUF1469  53.04 
 
 
142 aa  114  6e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2992  hypothetical protein  47.01 
 
 
146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0221  hypothetical protein  51.3 
 
 
202 aa  93.2  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.253727 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6022  hypothetical protein  40 
 
 
156 aa  92  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6667  hypothetical protein  50.39 
 
 
193 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126358  normal  0.676846 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0131  hypothetical protein  32.03 
 
 
153 aa  70.1  0.000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.241414  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0344  hypothetical protein  30.77 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0724  protein of unknown function DUF1469  31.25 
 
 
158 aa  67  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0210  hypothetical protein  35.96 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2340  protein of unknown function DUF1469  36.21 
 
 
157 aa  62.8  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0475  hypothetical protein  38.17 
 
 
157 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4232  protein of unknown function DUF1469  50 
 
 
145 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645637  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2073  protein of unknown function DUF1469  38.02 
 
 
137 aa  60.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4481  protein of unknown function DUF1469  32.35 
 
 
157 aa  60.8  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.105215 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5428  hypothetical protein  31.78 
 
 
175 aa  57.8  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1378  hypothetical protein  30.23 
 
 
169 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0194818  normal  0.100632 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13700  transmembrane protein  32.81 
 
 
172 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0470389 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0417  protein of unknown function DUF1469  37.18 
 
 
165 aa  53.5  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0343446  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1772  hypothetical protein  34.21 
 
 
151 aa  52.8  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4294  hypothetical protein  35.56 
 
 
248 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.121888  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1045  hypothetical protein  31.78 
 
 
133 aa  51.2  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0593921  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1759  hypothetical protein  35.19 
 
 
151 aa  51.2  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0234108 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2383  putative integral membrane protein  31.78 
 
 
133 aa  51.2  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0168516  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1591  hypothetical protein  31.54 
 
 
151 aa  51.2  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0321  hypothetical protein  35.9 
 
 
163 aa  50.4  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.202745  normal  0.194337 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2903  protein of unknown function DUF1469  35.51 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708128  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3925  protein of unknown function DUF1469  30.83 
 
 
171 aa  50.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.962598  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25370  Protein of unknown function (DUF1469)  26.5 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2210  hypothetical protein  34.4 
 
 
132 aa  48.9  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.554398  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5332  protein of unknown function DUF1469  35.05 
 
 
158 aa  48.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.113739 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2275  hypothetical protein  31.86 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3353  protein of unknown function DUF1469  40.57 
 
 
145 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2283  hypothetical protein  31.9 
 
 
134 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.122746  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2236  hypothetical protein  31.9 
 
 
134 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861722  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4811  hypothetical protein  29.55 
 
 
170 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.674359  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4897  hypothetical protein  29.55 
 
 
170 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.912667  normal  0.0700179 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5198  hypothetical protein  29.55 
 
 
170 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0142568  hitchhiker  0.000165751 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0525  protein of unknown function DUF1469  35.2 
 
 
168 aa  47.4  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.822053  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0260  protein of unknown function DUF1469  50 
 
 
155 aa  44.3  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.864061  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0178  hypothetical protein  29.91 
 
 
149 aa  44.7  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34040  Protein of unknown function (DUF1469)  31.82 
 
 
140 aa  44.3  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3084  protein of unknown function DUF1469  32.54 
 
 
138 aa  43.5  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4774  protein of unknown function DUF1469  47.83 
 
 
151 aa  42.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.487422  normal  0.301166 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5356  protein of unknown function DUF1469  29.5 
 
 
171 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.586134  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36060  Protein of unknown function (DUF1469)  30.16 
 
 
169 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328772  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0512  protein of unknown function DUF1469  31.9 
 
 
175 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1891  hypothetical protein  31.13 
 
 
133 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.373064  normal  0.485358 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>