45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3925 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3925  protein of unknown function DUF1469  100 
 
 		 171 aa  337  7e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.962598  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4811  hypothetical protein  59.59 
 
 		 170 aa  147  6e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.674359  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4897  hypothetical protein  59.59 
 
 		 170 aa  147  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.912667  normal  0.0700179 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1378  hypothetical protein  61.83 
 
 		 169 aa  147  9e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0194818  normal  0.100632 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5198  hypothetical protein  58.9 
 
 		 170 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0142568  hitchhiker  0.000165751 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5428  hypothetical protein  61.19 
 
 		 175 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13700  transmembrane protein  50.93 
 
 		 172 aa  143  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0470389 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0260  protein of unknown function DUF1469  50.34 
 
 		 155 aa  127  8.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.864061  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36060  Protein of unknown function (DUF1469)  52.67 
 
 		 169 aa  125  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328772  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0724  protein of unknown function DUF1469  43.84 
 
 		 158 aa  120  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0512  protein of unknown function DUF1469  46.27 
 
 		 175 aa  114  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25370  Protein of unknown function (DUF1469)  39.68 
 
 		 155 aa  92  4e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0417  protein of unknown function DUF1469  37.31 
 
 		 165 aa  73.9  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0343446  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0555  protein of unknown function DUF1469  38.21 
 
 		 180 aa  72.4  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000647144 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0344  hypothetical protein  33.86 
 
 		 139 aa  72  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0525  protein of unknown function DUF1469  37.4 
 
 		 168 aa  70.5  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.822053  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0475  hypothetical protein  35.07 
 
 		 157 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0210  hypothetical protein  30.14 
 
 		 156 aa  62  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0131  hypothetical protein  29.27 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.241414  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5332  protein of unknown function DUF1469  36.76 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.113739 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2340  protein of unknown function DUF1469  33.87 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6022  hypothetical protein  33.13 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0561  protein of unknown function DUF1469  31.91 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0347  hypothetical protein  30.94 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4481  protein of unknown function DUF1469  30.13 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.105215 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0051  protein of unknown function DUF1469  31.34 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4843  protein of unknown function DUF1469  40.24 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01420  Protein of unknown function (DUF1469)  31.51 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12680  Protein of unknown function (DUF1469)  26.67 
 
 		 160 aa  51.2  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0932  hypothetical protein  30.08 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2903  protein of unknown function DUF1469  34.78 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1772  hypothetical protein  31.78 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4294  hypothetical protein  26.35 
 
 		 248 aa  48.5  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.121888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3084  protein of unknown function DUF1469  32.99 
 
 		 138 aa  48.5  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0221  hypothetical protein  31.16 
 
 		 202 aa  47  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.253727 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0809  protein of unknown function DUF1469  33.06 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1759  hypothetical protein  32.71 
 
 		 151 aa  45.8  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0234108 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1321  protein of unknown function DUF1469  30.14 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1006  hypothetical protein  30.77 
 
 		 149 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0515851  hitchhiker  0.00247908 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34040  Protein of unknown function (DUF1469)  30.65 
 
 		 140 aa  43.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0321  hypothetical protein  27.2 
 
 		 163 aa  43.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.202745  normal  0.194337 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2137  hypothetical protein  29.13 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.375802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2073  protein of unknown function DUF1469  28.93 
 
 		 137 aa  42  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27570  Protein of unknown function (DUF1469)  30.85 
 
 		 138 aa  41.6  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5356  protein of unknown function DUF1469  27.42 
 
 		 171 aa  40.8  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.586134  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>