48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4897 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4811  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  340  7e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.674359  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4897  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  340  7e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.912667  normal  0.0700179 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5198  hypothetical protein  99.41 
 
 
170 aa  340  8e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0142568  hitchhiker  0.000165751 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5428  hypothetical protein  81.55 
 
 
175 aa  256  8e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1378  hypothetical protein  80.59 
 
 
169 aa  252  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0194818  normal  0.100632 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13700  transmembrane protein  74.57 
 
 
172 aa  241  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0470389 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3925  protein of unknown function DUF1469  59.59 
 
 
171 aa  154  7e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.962598  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0260  protein of unknown function DUF1469  58.82 
 
 
155 aa  127  8.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.864061  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0724  protein of unknown function DUF1469  50.78 
 
 
158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36060  Protein of unknown function (DUF1469)  52.71 
 
 
169 aa  114  7.999999999999999e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328772  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0512  protein of unknown function DUF1469  46.51 
 
 
175 aa  96.7  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25370  Protein of unknown function (DUF1469)  43.51 
 
 
155 aa  89  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0525  protein of unknown function DUF1469  42.19 
 
 
168 aa  78.6  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.822053  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0344  hypothetical protein  38.21 
 
 
139 aa  78.2  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0417  protein of unknown function DUF1469  36.88 
 
 
165 aa  73.6  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0343446  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0555  protein of unknown function DUF1469  35.88 
 
 
180 aa  70.5  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000647144 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12680  Protein of unknown function (DUF1469)  33.59 
 
 
160 aa  68.2  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4294  hypothetical protein  34.78 
 
 
248 aa  68.2  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.121888  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4481  protein of unknown function DUF1469  32.41 
 
 
157 aa  67.4  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.105215 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2340  protein of unknown function DUF1469  36.89 
 
 
157 aa  66.2  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0210  hypothetical protein  31.79 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0475  hypothetical protein  36 
 
 
157 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0131  hypothetical protein  32.82 
 
 
153 aa  60.8  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.241414  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01420  Protein of unknown function (DUF1469)  31.25 
 
 
155 aa  60.5  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0051  protein of unknown function DUF1469  31.06 
 
 
142 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0347  hypothetical protein  30.77 
 
 
140 aa  60.5  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0561  protein of unknown function DUF1469  31.06 
 
 
142 aa  59.7  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34040  Protein of unknown function (DUF1469)  33.33 
 
 
140 aa  58.5  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0321  hypothetical protein  30.77 
 
 
163 aa  58.2  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.202745  normal  0.194337 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4843  protein of unknown function DUF1469  41.25 
 
 
144 aa  58.2  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2073  protein of unknown function DUF1469  38.14 
 
 
137 aa  57.4  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6022  hypothetical protein  34.15 
 
 
156 aa  55.1  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3084  protein of unknown function DUF1469  30.25 
 
 
138 aa  52.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2903  protein of unknown function DUF1469  33.33 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708128  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2992  hypothetical protein  29.41 
 
 
146 aa  51.6  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1772  hypothetical protein  31.21 
 
 
151 aa  51.6  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1759  hypothetical protein  33.33 
 
 
151 aa  50.8  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0234108 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0809  protein of unknown function DUF1469  32.28 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1321  protein of unknown function DUF1469  29.17 
 
 
175 aa  48.9  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0221  hypothetical protein  34.15 
 
 
202 aa  48.1  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.253727 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0932  hypothetical protein  32.26 
 
 
133 aa  47.8  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3353  protein of unknown function DUF1469  37 
 
 
145 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27570  Protein of unknown function (DUF1469)  34.78 
 
 
138 aa  45.1  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1591  hypothetical protein  48.84 
 
 
151 aa  44.7  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2137  hypothetical protein  31.15 
 
 
133 aa  44.3  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.375802  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1006  hypothetical protein  30.08 
 
 
149 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0515851  hitchhiker  0.00247908 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0178  hypothetical protein  28.69 
 
 
149 aa  41.2  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1604  protein of unknown function DUF1469  34.78 
 
 
151 aa  40.8  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.620738  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>