57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0932 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0932  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  254  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4481  protein of unknown function DUF1469  49.59 
 
 
157 aa  110  8.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.105215 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1772  hypothetical protein  49.21 
 
 
151 aa  105  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1759  hypothetical protein  46.56 
 
 
151 aa  105  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0234108 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2340  protein of unknown function DUF1469  42.86 
 
 
157 aa  99  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2137  hypothetical protein  45.67 
 
 
133 aa  92  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.375802  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3353  protein of unknown function DUF1469  50 
 
 
145 aa  91.7  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4774  protein of unknown function DUF1469  47.97 
 
 
151 aa  84  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.487422  normal  0.301166 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2275  hypothetical protein  48.76 
 
 
134 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3084  protein of unknown function DUF1469  38.17 
 
 
138 aa  81.3  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2073  protein of unknown function DUF1469  45.04 
 
 
137 aa  80.5  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2283  hypothetical protein  47.93 
 
 
134 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.122746  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2236  hypothetical protein  47.93 
 
 
134 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861722  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34040  Protein of unknown function (DUF1469)  38.71 
 
 
140 aa  78.6  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27570  Protein of unknown function (DUF1469)  40.77 
 
 
138 aa  77.8  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2903  protein of unknown function DUF1469  45.76 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708128  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0334  hypothetical protein  43.41 
 
 
134 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1993  protein of unknown function DUF1469  44.17 
 
 
137 aa  68.2  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.122307  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6022  hypothetical protein  35.29 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4218  protein of unknown function DUF1469  39.1 
 
 
132 aa  65.1  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3512  protein of unknown function DUF1469  42.86 
 
 
132 aa  64.7  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.377984 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0178  hypothetical protein  36.92 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6344  hypothetical protein  43.48 
 
 
133 aa  63.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.443827  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2992  hypothetical protein  34.81 
 
 
146 aa  58.2  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25370  Protein of unknown function (DUF1469)  33.33 
 
 
155 aa  57.4  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3925  protein of unknown function DUF1469  30.08 
 
 
171 aa  57  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.962598  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1814  protein of unknown function DUF1469  50.45 
 
 
142 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000011426  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0221  hypothetical protein  33.07 
 
 
202 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.253727 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0417  protein of unknown function DUF1469  36.84 
 
 
165 aa  53.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0343446  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1342  hypothetical protein  31.25 
 
 
308 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.255297  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1321  protein of unknown function DUF1469  34.45 
 
 
175 aa  51.6  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4811  hypothetical protein  32.26 
 
 
170 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.674359  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4897  hypothetical protein  32.26 
 
 
170 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.912667  normal  0.0700179 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5198  hypothetical protein  33.6 
 
 
170 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0142568  hitchhiker  0.000165751 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0809  protein of unknown function DUF1469  35.54 
 
 
142 aa  51.2  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1378  hypothetical protein  31.45 
 
 
169 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0194818  normal  0.100632 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0344  hypothetical protein  34.09 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0724  protein of unknown function DUF1469  30.89 
 
 
158 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4294  hypothetical protein  32.31 
 
 
248 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.121888  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12680  Protein of unknown function (DUF1469)  32.12 
 
 
160 aa  48.9  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36060  Protein of unknown function (DUF1469)  28.79 
 
 
169 aa  47.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328772  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1591  hypothetical protein  32.61 
 
 
151 aa  47  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1475  protein of unknown function DUF1469  38.89 
 
 
129 aa  46.2  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00110957  normal  0.391002 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5428  hypothetical protein  29.84 
 
 
175 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0260  protein of unknown function DUF1469  30.51 
 
 
155 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.864061  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0321  hypothetical protein  33.33 
 
 
163 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.202745  normal  0.194337 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3560  hypothetical protein  34.82 
 
 
134 aa  44.7  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.462126  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13700  transmembrane protein  28.23 
 
 
172 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0470389 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01420  Protein of unknown function (DUF1469)  30.71 
 
 
155 aa  43.9  0.0008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06670  Protein of unknown function (DUF1469)  35 
 
 
307 aa  43.5  0.0009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1378  protein of unknown function DUF1469  32.08 
 
 
284 aa  43.5  0.0009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000017645 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0555  protein of unknown function DUF1469  34.59 
 
 
180 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000647144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6549  protein of unknown function DUF1469  33.93 
 
 
140 aa  41.6  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0142295  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0561  protein of unknown function DUF1469  32.97 
 
 
142 aa  41.6  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0051  protein of unknown function DUF1469  32.97 
 
 
142 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11370  Protein of unknown function (DUF1469)  48.36 
 
 
137 aa  41.2  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3054  hypothetical protein  31.31 
 
 
145 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0916548  normal  0.287496 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>