41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4218 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4218  protein of unknown function DUF1469  100 
 
 
132 aa  255  2e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1759  hypothetical protein  46.03 
 
 
151 aa  105  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0234108 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1772  hypothetical protein  46.34 
 
 
151 aa  104  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34040  Protein of unknown function (DUF1469)  43.7 
 
 
140 aa  100  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4481  protein of unknown function DUF1469  39.53 
 
 
157 aa  92  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.105215 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2340  protein of unknown function DUF1469  38.98 
 
 
157 aa  85.5  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3353  protein of unknown function DUF1469  47.29 
 
 
145 aa  81.3  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2903  protein of unknown function DUF1469  43.33 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708128  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4774  protein of unknown function DUF1469  45.6 
 
 
151 aa  77.4  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.487422  normal  0.301166 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2137  hypothetical protein  36.36 
 
 
133 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.375802  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2236  hypothetical protein  41.46 
 
 
134 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2283  hypothetical protein  41.46 
 
 
134 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.122746  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2275  hypothetical protein  41.46 
 
 
134 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6344  hypothetical protein  49.59 
 
 
133 aa  73.9  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.443827  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3084  protein of unknown function DUF1469  33.59 
 
 
138 aa  73.6  0.0000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27570  Protein of unknown function (DUF1469)  36.43 
 
 
138 aa  73.6  0.0000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0932  hypothetical protein  39.1 
 
 
133 aa  71.6  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1993  protein of unknown function DUF1469  46.34 
 
 
137 aa  69.7  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.122307  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0334  hypothetical protein  40.52 
 
 
134 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2073  protein of unknown function DUF1469  40.48 
 
 
137 aa  62  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1342  hypothetical protein  35.83 
 
 
308 aa  60.1  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.255297  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3512  protein of unknown function DUF1469  40.5 
 
 
132 aa  59.3  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.377984 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1814  protein of unknown function DUF1469  43.2 
 
 
142 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000011426  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2992  hypothetical protein  30.16 
 
 
146 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1378  protein of unknown function DUF1469  37.82 
 
 
284 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000017645 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1591  hypothetical protein  33.1 
 
 
151 aa  53.9  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0178  hypothetical protein  32.06 
 
 
149 aa  53.5  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06670  Protein of unknown function (DUF1469)  34.62 
 
 
307 aa  52  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34600  hypothetical protein  31.15 
 
 
120 aa  49.7  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1321  protein of unknown function DUF1469  32.06 
 
 
175 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6549  protein of unknown function DUF1469  30.43 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0142295  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36060  Protein of unknown function (DUF1469)  32.12 
 
 
169 aa  47  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328772  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0724  protein of unknown function DUF1469  26.77 
 
 
158 aa  44.3  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1045  hypothetical protein  38.1 
 
 
133 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0593921  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2383  putative integral membrane protein  38.1 
 
 
133 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0168516  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6022  hypothetical protein  28.8 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12680  Protein of unknown function (DUF1469)  30.65 
 
 
160 aa  42  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25370  Protein of unknown function (DUF1469)  29.17 
 
 
155 aa  42  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0809  protein of unknown function DUF1469  30 
 
 
142 aa  40.8  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11370  Protein of unknown function (DUF1469)  41.46 
 
 
137 aa  40.8  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1891  hypothetical protein  36.8 
 
 
133 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.373064  normal  0.485358 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>