62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1993 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1993  protein of unknown function DUF1469  100 
 
 		 137 aa  256  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.122307  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1772  hypothetical protein  54.92 
 
 		 151 aa  119  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1759  hypothetical protein  54.1 
 
 		 151 aa  119  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0234108 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4481  protein of unknown function DUF1469  48.44 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.105215 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2137  hypothetical protein  53.97 
 
 		 133 aa  107  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.375802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3353  protein of unknown function DUF1469  52.38 
 
 		 145 aa  100  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2340  protein of unknown function DUF1469  39.39 
 
 		 157 aa  100  9e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27570  Protein of unknown function (DUF1469)  45.8 
 
 		 138 aa  94  7e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0932  hypothetical protein  43.44 
 
 		 133 aa  93.6  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2275  hypothetical protein  47.2 
 
 		 134 aa  90.9  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2903  protein of unknown function DUF1469  48.39 
 
 		 144 aa  89  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2236  hypothetical protein  47.2 
 
 		 134 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2283  hypothetical protein  47.2 
 
 		 134 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.122746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34040  Protein of unknown function (DUF1469)  40.83 
 
 		 140 aa  85.9  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6344  hypothetical protein  53.23 
 
 		 133 aa  84.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.443827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4774  protein of unknown function DUF1469  49.58 
 
 		 151 aa  81.3  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.487422  normal  0.301166 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2073  protein of unknown function DUF1469  47.93 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2992  hypothetical protein  41.73 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4218  protein of unknown function DUF1469  46.34 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0334  hypothetical protein  45.08 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6549  protein of unknown function DUF1469  38.76 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0142295  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3512  protein of unknown function DUF1469  44.63 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.377984 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6022  hypothetical protein  39.02 
 
 		 156 aa  73.9  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1814  protein of unknown function DUF1469  51.47 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000011426  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0555  protein of unknown function DUF1469  44.66 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000647144 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3084  protein of unknown function DUF1469  36.22 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1342  hypothetical protein  41.32 
 
 		 308 aa  67  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.255297  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0051  protein of unknown function DUF1469  37.84 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01420  Protein of unknown function (DUF1469)  45.37 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0809  protein of unknown function DUF1469  36.36 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0561  protein of unknown function DUF1469  37.84 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25370  Protein of unknown function (DUF1469)  32.12 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1321  protein of unknown function DUF1469  36.89 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0347  hypothetical protein  38.68 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0221  hypothetical protein  37.39 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.253727 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1384  protein of unknown function DUF1469  43.7 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000799445  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1378  protein of unknown function DUF1469  36.36 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000017645 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5428  hypothetical protein  34.31 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4294  hypothetical protein  35.94 
 
 		 248 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.121888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0724  protein of unknown function DUF1469  29.51 
 
 		 158 aa  53.5  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0178  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1378  hypothetical protein  33.33 
 
 		 169 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0194818  normal  0.100632 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1006  hypothetical protein  38 
 
 		 149 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0515851  hitchhiker  0.00247908 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11370  Protein of unknown function (DUF1469)  53.72 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1475  protein of unknown function DUF1469  34.96 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00110957  normal  0.391002 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3560  hypothetical protein  33.6 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.462126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1591  hypothetical protein  30.88 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13700  transmembrane protein  29.51 
 
 		 172 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0470389 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0344  hypothetical protein  31.36 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5621  protein of unknown function DUF1469  34.38 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.182455 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4232  protein of unknown function DUF1469  36.84 
 
 		 145 aa  44.7  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36060  Protein of unknown function (DUF1469)  32.69 
 
 		 169 aa  44.3  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328772  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3054  hypothetical protein  37.37 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0916548  normal  0.287496 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4179  hypothetical protein  34.09 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.865834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0417  protein of unknown function DUF1469  33.33 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0343446  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06670  Protein of unknown function (DUF1469)  32.52 
 
 		 307 aa  41.6  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34600  hypothetical protein  32.5 
 
 		 120 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4815  protein of unknown function DUF1469  31.36 
 
 		 131 aa  41.6  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6667  hypothetical protein  39.84 
 
 		 193 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126358  normal  0.676846 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3925  protein of unknown function DUF1469  30.77 
 
 		 171 aa  41.6  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.962598  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0321  hypothetical protein  30.6 
 
 		 163 aa  40.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.202745  normal  0.194337 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5356  protein of unknown function DUF1469  30.23 
 
 		 171 aa  40.4  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.586134  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>