21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_34600 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_34600  hypothetical protein  100 
 
 
120 aa  235  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1591  hypothetical protein  37.9 
 
 
151 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1321  protein of unknown function DUF1469  38.84 
 
 
175 aa  63.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4815  protein of unknown function DUF1469  35.04 
 
 
131 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2992  hypothetical protein  37.84 
 
 
146 aa  52  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3900  putative nutrient deprivation-induced protein  31.62 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0615251  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34040  Protein of unknown function (DUF1469)  33.6 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5621  protein of unknown function DUF1469  32 
 
 
138 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.182455 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2210  hypothetical protein  32.77 
 
 
132 aa  47  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.554398  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3084  protein of unknown function DUF1469  25.86 
 
 
138 aa  44.7  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5260  nutrient deprivation-induced protein  30.65 
 
 
138 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3353  protein of unknown function DUF1469  30.83 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27570  Protein of unknown function (DUF1469)  30.51 
 
 
138 aa  43.5  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4481  protein of unknown function DUF1469  29.66 
 
 
157 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.105215 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0051  protein of unknown function DUF1469  36.36 
 
 
142 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1247  hypothetical protein  26.72 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.391441  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0561  protein of unknown function DUF1469  36.36 
 
 
142 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3869  hypothetical protein  25 
 
 
130 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.748627  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1045  hypothetical protein  33.62 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0593921  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2383  putative integral membrane protein  33.62 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0168516  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2340  protein of unknown function DUF1469  26.72 
 
 
157 aa  41.2  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>