31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4815 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4815  protein of unknown function DUF1469  100 
 
 		 131 aa  249  8.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1552  hypothetical protein  55.37 
 
 		 140 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1831  protein of unknown function DUF1469  55.37 
 
 		 135 aa  118  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.371829 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1689  protein of unknown function DUF1469  54.55 
 
 		 138 aa  118  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7553  protein of unknown function DUF1469  58.14 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0520584  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6820  hypothetical protein  57.36 
 
 		 131 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1483  hypothetical protein  56.45 
 
 		 145 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000255218 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5621  protein of unknown function DUF1469  33.58 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.182455 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4179  hypothetical protein  36.8 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.865834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34600  hypothetical protein  35.04 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3869  hypothetical protein  35.54 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.748627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7599  protein of unknown function DUF1469  39.81 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4599  hypothetical protein  33.06 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1438  protein of unknown function DUF1469  38.84 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.157465  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1591  hypothetical protein  35.11 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1300  hypothetical protein  33.93 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.726598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1247  hypothetical protein  37.29 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.391441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3900  putative nutrient deprivation-induced protein  31.82 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0615251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3560  hypothetical protein  35.34 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.462126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2210  hypothetical protein  37.01 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.554398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2992  hypothetical protein  37.84 
 
 		 146 aa  50.4  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1045  hypothetical protein  35.71 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0593921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2383  putative integral membrane protein  35.71 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0168516  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25370  Protein of unknown function (DUF1469)  37.76 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3878  hypothetical protein  29.75 
 
 		 131 aa  42.7  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.716332  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0555  protein of unknown function DUF1469  36.84 
 
 		 180 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000647144 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0809  protein of unknown function DUF1469  32.77 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3142  hypothetical protein  34.68 
 
 		 131 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0407  putative integral membrane protein  29.27 
 
 		 141 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.131115 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1378  hypothetical protein  37.14 
 
 		 169 aa  40.8  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0194818  normal  0.100632 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27570  Protein of unknown function (DUF1469)  32.81 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>