34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1483 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1483  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  282  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000255218 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1552  hypothetical protein  66.67 
 
 
140 aa  159  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1689  protein of unknown function DUF1469  66.67 
 
 
138 aa  158  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1831  protein of unknown function DUF1469  66.67 
 
 
135 aa  158  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.371829 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7553  protein of unknown function DUF1469  69.29 
 
 
131 aa  135  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0520584  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6820  hypothetical protein  68.46 
 
 
131 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4815  protein of unknown function DUF1469  56.45 
 
 
131 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1591  hypothetical protein  35.97 
 
 
151 aa  68.2  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1300  hypothetical protein  35.77 
 
 
129 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.726598  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3560  hypothetical protein  34.35 
 
 
134 aa  56.2  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.462126  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0344  hypothetical protein  31.21 
 
 
139 aa  53.9  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2210  hypothetical protein  38.17 
 
 
132 aa  50.8  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.554398  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27570  Protein of unknown function (DUF1469)  31.88 
 
 
138 aa  50.1  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3084  protein of unknown function DUF1469  32.12 
 
 
138 aa  49.7  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7599  protein of unknown function DUF1469  35.16 
 
 
121 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25370  Protein of unknown function (DUF1469)  34.58 
 
 
155 aa  48.1  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34600  hypothetical protein  27.35 
 
 
120 aa  47.4  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4481  protein of unknown function DUF1469  28.17 
 
 
157 aa  46.2  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.105215 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34040  Protein of unknown function (DUF1469)  30.66 
 
 
140 aa  46.2  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2340  protein of unknown function DUF1469  29.63 
 
 
157 aa  45.4  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4179  hypothetical protein  29.93 
 
 
136 aa  43.9  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.865834  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1772  hypothetical protein  30.22 
 
 
151 aa  43.9  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3869  hypothetical protein  33.33 
 
 
130 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.748627  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0809  protein of unknown function DUF1469  30.4 
 
 
142 aa  42.7  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6022  hypothetical protein  32.35 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2903  protein of unknown function DUF1469  33.61 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708128  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5621  protein of unknown function DUF1469  27.86 
 
 
138 aa  42  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.182455 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4294  hypothetical protein  29.58 
 
 
248 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.121888  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1045  hypothetical protein  36.07 
 
 
133 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0593921  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2383  putative integral membrane protein  36.07 
 
 
133 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0168516  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5428  hypothetical protein  28 
 
 
175 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1438  protein of unknown function DUF1469  30.89 
 
 
130 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.157465  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3900  putative nutrient deprivation-induced protein  31.3 
 
 
139 aa  40.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0615251  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1247  hypothetical protein  33.61 
 
 
129 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.391441  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>