48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4294 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4294  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  486  1e-136  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.121888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0321  hypothetical protein  73.57 
 
 		 163 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.202745  normal  0.194337 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0344  hypothetical protein  33.61 
 
 		 139 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6022  hypothetical protein  35.51 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2992  hypothetical protein  38.46 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0417  protein of unknown function DUF1469  41.89 
 
 		 165 aa  77.4  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0343446  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0809  protein of unknown function DUF1469  38.46 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0555  protein of unknown function DUF1469  39.5 
 
 		 180 aa  73.9  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000647144 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0525  protein of unknown function DUF1469  44.74 
 
 		 168 aa  73.2  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.822053  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5428  hypothetical protein  38.26 
 
 		 175 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1378  hypothetical protein  35.65 
 
 		 169 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0194818  normal  0.100632 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13700  transmembrane protein  30 
 
 		 172 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0470389 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2073  protein of unknown function DUF1469  36.3 
 
 		 137 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0221  hypothetical protein  36 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.253727 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3084  protein of unknown function DUF1469  41.35 
 
 		 138 aa  61.6  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1772  hypothetical protein  39.84 
 
 		 151 aa  61.6  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1759  hypothetical protein  39.2 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0234108 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1321  protein of unknown function DUF1469  35.9 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0210  hypothetical protein  35.4 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0724  protein of unknown function DUF1469  31.09 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0475  hypothetical protein  35.09 
 
 		 157 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25370  Protein of unknown function (DUF1469)  34.67 
 
 		 155 aa  53.9  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4897  hypothetical protein  34.78 
 
 		 170 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.912667  normal  0.0700179 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4811  hypothetical protein  34.78 
 
 		 170 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.674359  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36060  Protein of unknown function (DUF1469)  30.41 
 
 		 169 aa  53.5  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328772  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5198  hypothetical protein  34.78 
 
 		 170 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0142568  hitchhiker  0.000165751 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0347  hypothetical protein  35.56 
 
 		 140 aa  52.8  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0051  protein of unknown function DUF1469  32.54 
 
 		 142 aa  52.4  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0178  hypothetical protein  34.04 
 
 		 149 aa  52.4  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34040  Protein of unknown function (DUF1469)  35.94 
 
 		 140 aa  52  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2340  protein of unknown function DUF1469  33.08 
 
 		 157 aa  52  0.000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0561  protein of unknown function DUF1469  32.54 
 
 		 142 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0260  protein of unknown function DUF1469  32 
 
 		 155 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.864061  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0512  protein of unknown function DUF1469  34.36 
 
 		 175 aa  49.7  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4481  protein of unknown function DUF1469  28.57 
 
 		 157 aa  49.3  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.105215 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4232  protein of unknown function DUF1469  34.92 
 
 		 145 aa  48.9  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645637  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01420  Protein of unknown function (DUF1469)  31.08 
 
 		 155 aa  47.8  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2283  hypothetical protein  31.78 
 
 		 134 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.122746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2236  hypothetical protein  31.78 
 
 		 134 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861722  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2275  hypothetical protein  29.32 
 
 		 134 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6667  hypothetical protein  35.56 
 
 		 193 aa  46.2  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126358  normal  0.676846 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0932  hypothetical protein  32.82 
 
 		 133 aa  45.8  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12680  Protein of unknown function (DUF1469)  33.33 
 
 		 160 aa  45.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2210  hypothetical protein  32.26 
 
 		 132 aa  44.7  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.554398  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3925  protein of unknown function DUF1469  28.78 
 
 		 171 aa  44.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.962598  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4774  protein of unknown function DUF1469  30.33 
 
 		 151 aa  43.5  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.487422  normal  0.301166 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4843  protein of unknown function DUF1469  37.78 
 
 		 144 aa  43.1  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0334  hypothetical protein  41.82 
 
 		 134 aa  42.7  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>