43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13700 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13700  transmembrane protein  100 
 
 
172 aa  341  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0470389 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4811  hypothetical protein  74.57 
 
 
170 aa  225  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.674359  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4897  hypothetical protein  74.57 
 
 
170 aa  225  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.912667  normal  0.0700179 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5198  hypothetical protein  73.99 
 
 
170 aa  224  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0142568  hitchhiker  0.000165751 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5428  hypothetical protein  69.05 
 
 
175 aa  222  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1378  hypothetical protein  70 
 
 
169 aa  219  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0194818  normal  0.100632 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3925  protein of unknown function DUF1469  50.93 
 
 
171 aa  143  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.962598  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0724  protein of unknown function DUF1469  47.66 
 
 
158 aa  118  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0260  protein of unknown function DUF1469  48.63 
 
 
155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.864061  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36060  Protein of unknown function (DUF1469)  42.86 
 
 
169 aa  103  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328772  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0512  protein of unknown function DUF1469  42.25 
 
 
175 aa  95.1  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25370  Protein of unknown function (DUF1469)  35.61 
 
 
155 aa  87.8  6e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0417  protein of unknown function DUF1469  37.09 
 
 
165 aa  74.7  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0343446  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0555  protein of unknown function DUF1469  37.06 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000647144 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0525  protein of unknown function DUF1469  36.52 
 
 
168 aa  68.6  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.822053  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4294  hypothetical protein  30 
 
 
248 aa  68.2  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.121888  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0475  hypothetical protein  30.4 
 
 
157 aa  67.4  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0210  hypothetical protein  30.15 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01420  Protein of unknown function (DUF1469)  30.07 
 
 
155 aa  64.3  0.0000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1772  hypothetical protein  33.57 
 
 
151 aa  62.8  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0344  hypothetical protein  27.41 
 
 
139 aa  61.6  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0321  hypothetical protein  30.43 
 
 
163 aa  60.8  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.202745  normal  0.194337 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0347  hypothetical protein  32.81 
 
 
140 aa  60.8  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0561  protein of unknown function DUF1469  29.92 
 
 
142 aa  60.5  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2340  protein of unknown function DUF1469  30.08 
 
 
157 aa  60.5  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4481  protein of unknown function DUF1469  29.23 
 
 
157 aa  60.5  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.105215 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0051  protein of unknown function DUF1469  29.92 
 
 
142 aa  59.7  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6022  hypothetical protein  32.67 
 
 
156 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12680  Protein of unknown function (DUF1469)  26.81 
 
 
160 aa  54.7  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0131  hypothetical protein  27.27 
 
 
153 aa  54.3  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.241414  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1759  hypothetical protein  31.11 
 
 
151 aa  53.9  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0234108 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4843  protein of unknown function DUF1469  33.71 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2073  protein of unknown function DUF1469  32.76 
 
 
137 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1321  protein of unknown function DUF1469  27.73 
 
 
175 aa  51.6  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34040  Protein of unknown function (DUF1469)  28.91 
 
 
140 aa  50.4  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2903  protein of unknown function DUF1469  31.63 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708128  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0809  protein of unknown function DUF1469  33.04 
 
 
142 aa  48.9  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3353  protein of unknown function DUF1469  31.01 
 
 
145 aa  48.1  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27570  Protein of unknown function (DUF1469)  32.94 
 
 
138 aa  47.4  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0221  hypothetical protein  32.74 
 
 
202 aa  45.4  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.253727 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2992  hypothetical protein  27.97 
 
 
146 aa  44.7  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3084  protein of unknown function DUF1469  28.85 
 
 
138 aa  42.4  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3512  protein of unknown function DUF1469  31.25 
 
 
132 aa  41.6  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.377984 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>