56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0724 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0724  protein of unknown function DUF1469  100 
 
 
158 aa  310  4.999999999999999e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36060  Protein of unknown function (DUF1469)  47.44 
 
 
169 aa  127  9.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328772  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3925  protein of unknown function DUF1469  46.21 
 
 
171 aa  111  4.0000000000000004e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.962598  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13700  transmembrane protein  47.76 
 
 
172 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0470389 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0260  protein of unknown function DUF1469  46.75 
 
 
155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.864061  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1378  hypothetical protein  47.66 
 
 
169 aa  103  8e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0194818  normal  0.100632 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5428  hypothetical protein  46.62 
 
 
175 aa  103  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4811  hypothetical protein  51.94 
 
 
170 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.674359  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4897  hypothetical protein  51.94 
 
 
170 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.912667  normal  0.0700179 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5198  hypothetical protein  51.94 
 
 
170 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0142568  hitchhiker  0.000165751 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0417  protein of unknown function DUF1469  44.12 
 
 
165 aa  92.8  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0343446  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25370  Protein of unknown function (DUF1469)  40.48 
 
 
155 aa  90.9  7e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0344  hypothetical protein  37.5 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0555  protein of unknown function DUF1469  38.84 
 
 
180 aa  77.8  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000647144 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0512  protein of unknown function DUF1469  36.18 
 
 
175 aa  76.6  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0561  protein of unknown function DUF1469  36.61 
 
 
142 aa  76.3  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0051  protein of unknown function DUF1469  36.61 
 
 
142 aa  75.5  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2340  protein of unknown function DUF1469  31.13 
 
 
157 aa  70.5  0.000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0347  hypothetical protein  31.09 
 
 
140 aa  67.8  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0131  hypothetical protein  30.77 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.241414  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0475  hypothetical protein  36.67 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0210  hypothetical protein  36.28 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0525  protein of unknown function DUF1469  37.4 
 
 
168 aa  63.9  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.822053  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2992  hypothetical protein  36.99 
 
 
146 aa  63.9  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1772  hypothetical protein  35.29 
 
 
151 aa  62.8  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1759  hypothetical protein  33.33 
 
 
151 aa  61.2  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0234108 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2073  protein of unknown function DUF1469  39.13 
 
 
137 aa  61.2  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2903  protein of unknown function DUF1469  32.77 
 
 
144 aa  60.8  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708128  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4481  protein of unknown function DUF1469  31.73 
 
 
157 aa  60.1  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.105215 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01420  Protein of unknown function (DUF1469)  30.77 
 
 
155 aa  59.7  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3353  protein of unknown function DUF1469  35.46 
 
 
145 aa  60.1  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0221  hypothetical protein  37.5 
 
 
202 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.253727 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0809  protein of unknown function DUF1469  37.7 
 
 
142 aa  58.5  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2236  hypothetical protein  31.68 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861722  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1321  protein of unknown function DUF1469  30.51 
 
 
175 aa  56.6  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2283  hypothetical protein  31.68 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.122746  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0321  hypothetical protein  33.85 
 
 
163 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.202745  normal  0.194337 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34040  Protein of unknown function (DUF1469)  30.33 
 
 
140 aa  56.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4294  hypothetical protein  28.47 
 
 
248 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.121888  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12680  Protein of unknown function (DUF1469)  32.82 
 
 
160 aa  55.5  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2275  hypothetical protein  31.25 
 
 
134 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6022  hypothetical protein  30.23 
 
 
156 aa  52.4  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5332  protein of unknown function DUF1469  39.58 
 
 
158 aa  51.6  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.113739 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27570  Protein of unknown function (DUF1469)  30.53 
 
 
138 aa  50.8  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6549  protein of unknown function DUF1469  35 
 
 
140 aa  48.5  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0142295  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0932  hypothetical protein  28.68 
 
 
133 aa  47.4  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3084  protein of unknown function DUF1469  33.02 
 
 
138 aa  46.2  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5356  protein of unknown function DUF1469  34.31 
 
 
171 aa  45.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.586134  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4843  protein of unknown function DUF1469  36.14 
 
 
144 aa  44.7  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0334  hypothetical protein  30.83 
 
 
134 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6344  hypothetical protein  35.25 
 
 
133 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.443827  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1045  hypothetical protein  29.09 
 
 
133 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0593921  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2383  putative integral membrane protein  29.09 
 
 
133 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0168516  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1006  hypothetical protein  31.86 
 
 
149 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0515851  hitchhiker  0.00247908 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6667  hypothetical protein  48.33 
 
 
193 aa  42  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126358  normal  0.676846 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2210  hypothetical protein  27.91 
 
 
132 aa  41.2  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.554398  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>