49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0321 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0321  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  322  1e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.202745  normal  0.194337 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4294  hypothetical protein  75.74 
 
 
248 aa  205  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.121888  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0344  hypothetical protein  38.79 
 
 
139 aa  80.5  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2992  hypothetical protein  38.4 
 
 
146 aa  74.7  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0555  protein of unknown function DUF1469  44.35 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000647144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6022  hypothetical protein  33.09 
 
 
156 aa  72  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0417  protein of unknown function DUF1469  39.16 
 
 
165 aa  70.9  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0343446  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0525  protein of unknown function DUF1469  40 
 
 
168 aa  69.3  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.822053  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2073  protein of unknown function DUF1469  39.69 
 
 
137 aa  68.2  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1759  hypothetical protein  37.01 
 
 
151 aa  67  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0234108 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0809  protein of unknown function DUF1469  35.16 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1772  hypothetical protein  38.1 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5428  hypothetical protein  33.91 
 
 
175 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1378  hypothetical protein  33.91 
 
 
169 aa  61.6  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0194818  normal  0.100632 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13700  transmembrane protein  30.43 
 
 
172 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0470389 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1321  protein of unknown function DUF1469  34.88 
 
 
175 aa  58.5  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3084  protein of unknown function DUF1469  36.29 
 
 
138 aa  56.2  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0221  hypothetical protein  32.58 
 
 
202 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.253727 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0051  protein of unknown function DUF1469  36.28 
 
 
142 aa  55.5  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4481  protein of unknown function DUF1469  30.28 
 
 
157 aa  54.7  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.105215 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0210  hypothetical protein  33.33 
 
 
156 aa  54.7  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0561  protein of unknown function DUF1469  35.4 
 
 
142 aa  53.9  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36060  Protein of unknown function (DUF1469)  31.71 
 
 
169 aa  53.9  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328772  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34040  Protein of unknown function (DUF1469)  30.4 
 
 
140 aa  52.4  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0724  protein of unknown function DUF1469  34.19 
 
 
158 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0475  hypothetical protein  35.77 
 
 
157 aa  52  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0347  hypothetical protein  35.9 
 
 
140 aa  50.4  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5198  hypothetical protein  30.77 
 
 
170 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0142568  hitchhiker  0.000165751 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4897  hypothetical protein  30.77 
 
 
170 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.912667  normal  0.0700179 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4811  hypothetical protein  30.77 
 
 
170 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.674359  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4232  protein of unknown function DUF1469  33.06 
 
 
145 aa  48.9  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645637  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2903  protein of unknown function DUF1469  35 
 
 
144 aa  48.5  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708128  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2275  hypothetical protein  29.1 
 
 
134 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4774  protein of unknown function DUF1469  30.4 
 
 
151 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.487422  normal  0.301166 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0260  protein of unknown function DUF1469  30.3 
 
 
155 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.864061  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0512  protein of unknown function DUF1469  35.38 
 
 
175 aa  45.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2210  hypothetical protein  27.27 
 
 
132 aa  45.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.554398  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27570  Protein of unknown function (DUF1469)  30.83 
 
 
138 aa  45.4  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0178  hypothetical protein  32.26 
 
 
149 aa  45.1  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01420  Protein of unknown function (DUF1469)  32.84 
 
 
155 aa  44.7  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2340  protein of unknown function DUF1469  29.37 
 
 
157 aa  44.3  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2236  hypothetical protein  28.36 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861722  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3560  hypothetical protein  33.91 
 
 
134 aa  43.9  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.462126  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0932  hypothetical protein  32.39 
 
 
133 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2283  hypothetical protein  28.36 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.122746  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0334  hypothetical protein  44.23 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12680  Protein of unknown function (DUF1469)  29.01 
 
 
160 aa  42  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3925  protein of unknown function DUF1469  27.2 
 
 
171 aa  41.6  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.962598  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3512  protein of unknown function DUF1469  39.39 
 
 
132 aa  41.2  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.377984 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>