41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0178 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0178  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  286  5.0000000000000004e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2992  hypothetical protein  32.82 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34040  Protein of unknown function (DUF1469)  34.93 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4481  protein of unknown function DUF1469  33.07 
 
 		 157 aa  63.5  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.105215 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2073  protein of unknown function DUF1469  35.34 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0809  protein of unknown function DUF1469  33.33 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2903  protein of unknown function DUF1469  39.67 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1759  hypothetical protein  34.62 
 
 		 151 aa  57  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0234108 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27570  Protein of unknown function (DUF1469)  33.08 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1321  protein of unknown function DUF1469  31.78 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06670  Protein of unknown function (DUF1469)  34.62 
 
 		 307 aa  55.1  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0417  protein of unknown function DUF1469  31.15 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0343446  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6022  hypothetical protein  29.17 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0932  hypothetical protein  32.81 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4294  hypothetical protein  34.04 
 
 		 248 aa  53.5  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.121888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1772  hypothetical protein  33.85 
 
 		 151 aa  52.8  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12680  Protein of unknown function (DUF1469)  31.58 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5332  protein of unknown function DUF1469  37.08 
 
 		 158 aa  50.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.113739 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2340  protein of unknown function DUF1469  31.71 
 
 		 157 aa  50.8  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5356  protein of unknown function DUF1469  30.34 
 
 		 171 aa  50.8  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.586134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3084  protein of unknown function DUF1469  31.06 
 
 		 138 aa  50.4  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0555  protein of unknown function DUF1469  32.31 
 
 		 180 aa  48.5  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000647144 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1006  hypothetical protein  35.11 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0515851  hitchhiker  0.00247908 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4232  protein of unknown function DUF1469  34.4 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2275  hypothetical protein  28.46 
 
 		 134 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25370  Protein of unknown function (DUF1469)  30.83 
 
 		 155 aa  45.4  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2283  hypothetical protein  30.95 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.122746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2236  hypothetical protein  30.95 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861722  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0321  hypothetical protein  32.26 
 
 		 163 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.202745  normal  0.194337 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4774  protein of unknown function DUF1469  33.33 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.487422  normal  0.301166 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2210  hypothetical protein  28.68 
 
 		 132 aa  45.1  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.554398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0347  hypothetical protein  29.91 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0344  hypothetical protein  28.8 
 
 		 139 aa  43.9  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0221  hypothetical protein  31.45 
 
 		 202 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.253727 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0210  hypothetical protein  32.73 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01420  Protein of unknown function (DUF1469)  30.33 
 
 		 155 aa  42  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0051  protein of unknown function DUF1469  26.79 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0475  hypothetical protein  35.43 
 
 		 157 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5428  hypothetical protein  31.67 
 
 		 175 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0561  protein of unknown function DUF1469  26.79 
 
 		 142 aa  40.8  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1591  hypothetical protein  29.23 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>