63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4232 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4232  protein of unknown function DUF1469  100 
 
 		 145 aa  280  5.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2992  hypothetical protein  57.53 
 
 		 146 aa  156  8e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0809  protein of unknown function DUF1469  48.78 
 
 		 142 aa  122  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6022  hypothetical protein  43.57 
 
 		 156 aa  122  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0221  hypothetical protein  54.26 
 
 		 202 aa  119  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.253727 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0051  protein of unknown function DUF1469  51.3 
 
 		 142 aa  113  7.999999999999999e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0561  protein of unknown function DUF1469  50.43 
 
 		 142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1321  protein of unknown function DUF1469  49.15 
 
 		 175 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0347  hypothetical protein  46.83 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0555  protein of unknown function DUF1469  48.85 
 
 		 180 aa  105  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000647144 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01420  Protein of unknown function (DUF1469)  47.83 
 
 		 155 aa  100  6e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6667  hypothetical protein  58.47 
 
 		 193 aa  96.3  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126358  normal  0.676846 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0178  hypothetical protein  38.69 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2073  protein of unknown function DUF1469  40.44 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4294  hypothetical protein  33.97 
 
 		 248 aa  74.7  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.121888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4481  protein of unknown function DUF1469  32.56 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.105215 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0321  hypothetical protein  35.71 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.202745  normal  0.194337 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2903  protein of unknown function DUF1469  41.53 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2275  hypothetical protein  34.92 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2210  hypothetical protein  37.1 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.554398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34040  Protein of unknown function (DUF1469)  30.94 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1759  hypothetical protein  36.44 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0234108 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0417  protein of unknown function DUF1469  34.65 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0343446  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2283  hypothetical protein  34.92 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.122746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2236  hypothetical protein  34.92 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861722  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4774  protein of unknown function DUF1469  33.11 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.487422  normal  0.301166 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1591  hypothetical protein  32.06 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1384  protein of unknown function DUF1469  37.9 
 
 		 148 aa  57  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000799445  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1772  hypothetical protein  32.12 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27570  Protein of unknown function (DUF1469)  34.13 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25370  Protein of unknown function (DUF1469)  31.15 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5332  protein of unknown function DUF1469  39.8 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.113739 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2383  putative integral membrane protein  33.61 
 
 		 133 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0168516  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1891  hypothetical protein  36.22 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.373064  normal  0.485358 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1045  hypothetical protein  33.61 
 
 		 133 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0593921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3560  hypothetical protein  29.37 
 
 		 134 aa  50.8  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.462126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0344  hypothetical protein  26.45 
 
 		 139 aa  50.4  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2340  protein of unknown function DUF1469  30.5 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3353  protein of unknown function DUF1469  34.04 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34600  hypothetical protein  34.23 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0724  protein of unknown function DUF1469  30.37 
 
 		 158 aa  47  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1438  protein of unknown function DUF1469  33.88 
 
 		 130 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.157465  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5356  protein of unknown function DUF1469  28.91 
 
 		 171 aa  47  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.586134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0475  hypothetical protein  34.4 
 
 		 157 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0210  hypothetical protein  33.91 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06670  Protein of unknown function (DUF1469)  33.59 
 
 		 307 aa  45.4  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6549  protein of unknown function DUF1469  34.78 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0142295  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4815  protein of unknown function DUF1469  33.93 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5621  protein of unknown function DUF1469  28.68 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.182455 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3054  hypothetical protein  36.04 
 
 		 145 aa  43.5  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0916548  normal  0.287496 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0932  hypothetical protein  29.75 
 
 		 133 aa  43.5  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3900  putative nutrient deprivation-induced protein  30.77 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0615251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1378  hypothetical protein  31.15 
 
 		 169 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0194818  normal  0.100632 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4599  hypothetical protein  28.57 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1247  hypothetical protein  30.16 
 
 		 129 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.391441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1342  hypothetical protein  33.67 
 
 		 308 aa  41.2  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.255297  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0525  protein of unknown function DUF1469  32.58 
 
 		 168 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.822053  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3084  protein of unknown function DUF1469  33.01 
 
 		 138 aa  40.8  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3878  hypothetical protein  36.22 
 
 		 131 aa  40.4  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.716332  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6344  hypothetical protein  37.82 
 
 		 133 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.443827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2137  hypothetical protein  30.66 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.375802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1993  protein of unknown function DUF1469  36.21 
 
 		 137 aa  40.4  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.122307  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12680  Protein of unknown function (DUF1469)  32.26 
 
 		 160 aa  40  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>