68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6667 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6667  hypothetical protein  100 
 
 
193 aa  376  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126358  normal  0.676846 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0221  hypothetical protein  82.64 
 
 
202 aa  184  6e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.253727 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2992  hypothetical protein  51.75 
 
 
146 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0051  protein of unknown function DUF1469  57.52 
 
 
142 aa  121  5e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0561  protein of unknown function DUF1469  57.52 
 
 
142 aa  121  8e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0347  hypothetical protein  50.39 
 
 
140 aa  118  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6022  hypothetical protein  50 
 
 
156 aa  112  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0809  protein of unknown function DUF1469  47.11 
 
 
142 aa  108  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1321  protein of unknown function DUF1469  39.77 
 
 
175 aa  103  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4232  protein of unknown function DUF1469  58.47 
 
 
145 aa  97.4  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645637  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0555  protein of unknown function DUF1469  47.01 
 
 
180 aa  97.4  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000647144 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01420  Protein of unknown function (DUF1469)  48.21 
 
 
155 aa  97.4  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2073  protein of unknown function DUF1469  48 
 
 
137 aa  95.5  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4481  protein of unknown function DUF1469  42.07 
 
 
157 aa  86.7  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.105215 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4774  protein of unknown function DUF1469  43.41 
 
 
151 aa  74.7  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.487422  normal  0.301166 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4294  hypothetical protein  37.21 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.121888  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0724  protein of unknown function DUF1469  38.03 
 
 
158 aa  68.9  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2903  protein of unknown function DUF1469  44.35 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708128  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0344  hypothetical protein  36.52 
 
 
139 aa  67  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1759  hypothetical protein  43.1 
 
 
151 aa  67  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0234108 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0321  hypothetical protein  34.68 
 
 
163 aa  65.9  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.202745  normal  0.194337 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1591  hypothetical protein  34.96 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1772  hypothetical protein  42.61 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3084  protein of unknown function DUF1469  33.33 
 
 
138 aa  64.7  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2340  protein of unknown function DUF1469  32.77 
 
 
157 aa  64.3  0.0000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2210  hypothetical protein  40.5 
 
 
132 aa  64.3  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.554398  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25370  Protein of unknown function (DUF1469)  36.45 
 
 
155 aa  61.2  0.000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5428  hypothetical protein  34.19 
 
 
175 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2275  hypothetical protein  37.5 
 
 
134 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2236  hypothetical protein  35.88 
 
 
134 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2283  hypothetical protein  35.88 
 
 
134 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.122746  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1378  hypothetical protein  36.03 
 
 
169 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0194818  normal  0.100632 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34040  Protein of unknown function (DUF1469)  36.21 
 
 
140 aa  56.2  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1045  hypothetical protein  36.29 
 
 
133 aa  55.5  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0593921  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2383  putative integral membrane protein  36.29 
 
 
133 aa  55.5  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0168516  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13700  transmembrane protein  32.76 
 
 
172 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0470389 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0417  protein of unknown function DUF1469  33.9 
 
 
165 aa  53.9  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0343446  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0178  hypothetical protein  32.26 
 
 
149 aa  53.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3353  protein of unknown function DUF1469  39.5 
 
 
145 aa  53.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6549  protein of unknown function DUF1469  35.17 
 
 
140 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0142295  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36060  Protein of unknown function (DUF1469)  31.64 
 
 
169 aa  52.8  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328772  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1006  hypothetical protein  36.09 
 
 
149 aa  52.4  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0515851  hitchhiker  0.00247908 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0932  hypothetical protein  33.08 
 
 
133 aa  52  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27570  Protein of unknown function (DUF1469)  33.06 
 
 
138 aa  51.6  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1384  protein of unknown function DUF1469  34.92 
 
 
148 aa  51.2  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000799445  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4815  protein of unknown function DUF1469  34.71 
 
 
131 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2137  hypothetical protein  36.84 
 
 
133 aa  50.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.375802  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3560  hypothetical protein  29.23 
 
 
134 aa  50.8  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.462126  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6344  hypothetical protein  43.9 
 
 
133 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.443827  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1993  protein of unknown function DUF1469  39.84 
 
 
137 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.122307  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5621  protein of unknown function DUF1469  32.59 
 
 
138 aa  49.3  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.182455 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1891  hypothetical protein  35.16 
 
 
133 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.373064  normal  0.485358 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0512  protein of unknown function DUF1469  37.93 
 
 
175 aa  48.9  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4811  hypothetical protein  35.29 
 
 
170 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.674359  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5356  protein of unknown function DUF1469  33.11 
 
 
171 aa  47  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.586134  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4179  hypothetical protein  32.06 
 
 
136 aa  46.6  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.865834  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5198  hypothetical protein  35.29 
 
 
170 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0142568  hitchhiker  0.000165751 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4897  hypothetical protein  35.29 
 
 
170 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.912667  normal  0.0700179 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0525  protein of unknown function DUF1469  37.01 
 
 
168 aa  45.4  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.822053  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0475  hypothetical protein  34.75 
 
 
157 aa  44.7  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0260  protein of unknown function DUF1469  33.06 
 
 
155 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.864061  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3054  hypothetical protein  37.61 
 
 
145 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0916548  normal  0.287496 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5332  protein of unknown function DUF1469  38.16 
 
 
158 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.113739 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0334  hypothetical protein  46.03 
 
 
134 aa  43.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3900  putative nutrient deprivation-induced protein  31.65 
 
 
139 aa  42.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0615251  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34600  hypothetical protein  30.63 
 
 
120 aa  42  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4347  hypothetical protein  29.41 
 
 
147 aa  41.6  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232345  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12680  Protein of unknown function (DUF1469)  30.94 
 
 
160 aa  41.2  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>