46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_36060 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_36060  Protein of unknown function (DUF1469)  100 
 
 		 169 aa  341  2e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328772  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0724  protein of unknown function DUF1469  48.28 
 
 		 158 aa  133  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3925  protein of unknown function DUF1469  52.67 
 
 		 171 aa  124  6e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.962598  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0260  protein of unknown function DUF1469  47.55 
 
 		 155 aa  115  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.864061  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1378  hypothetical protein  50.39 
 
 		 169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0194818  normal  0.100632 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5428  hypothetical protein  48.82 
 
 		 175 aa  107  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4811  hypothetical protein  52.27 
 
 		 170 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.674359  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4897  hypothetical protein  52.27 
 
 		 170 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.912667  normal  0.0700179 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5198  hypothetical protein  52.27 
 
 		 170 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0142568  hitchhiker  0.000165751 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0512  protein of unknown function DUF1469  45.83 
 
 		 175 aa  104  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13700  transmembrane protein  42.86 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0470389 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0525  protein of unknown function DUF1469  38.71 
 
 		 168 aa  72  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.822053  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0344  hypothetical protein  35.56 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25370  Protein of unknown function (DUF1469)  33.33 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6022  hypothetical protein  34.87 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0131  hypothetical protein  31.06 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.241414  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0417  protein of unknown function DUF1469  35.88 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0343446  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2903  protein of unknown function DUF1469  36.13 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0475  hypothetical protein  35.59 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4294  hypothetical protein  30.41 
 
 		 248 aa  57.4  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.121888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2340  protein of unknown function DUF1469  29.6 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34040  Protein of unknown function (DUF1469)  29.37 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0555  protein of unknown function DUF1469  34.92 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000647144 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0051  protein of unknown function DUF1469  33.6 
 
 		 142 aa  57  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0561  protein of unknown function DUF1469  33.61 
 
 		 142 aa  57  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4481  protein of unknown function DUF1469  31.78 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.105215 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0321  hypothetical protein  31.71 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.202745  normal  0.194337 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1321  protein of unknown function DUF1469  31.2 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0210  hypothetical protein  32.59 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2992  hypothetical protein  33.07 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1772  hypothetical protein  32.5 
 
 		 151 aa  52  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1759  hypothetical protein  31.67 
 
 		 151 aa  51.6  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0234108 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3084  protein of unknown function DUF1469  32.54 
 
 		 138 aa  50.8  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1006  hypothetical protein  40 
 
 		 149 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0515851  hitchhiker  0.00247908 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5332  protein of unknown function DUF1469  40 
 
 		 158 aa  50.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.113739 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0221  hypothetical protein  37.65 
 
 		 202 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.253727 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2283  hypothetical protein  31.15 
 
 		 134 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.122746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0347  hypothetical protein  30.16 
 
 		 140 aa  48.5  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2236  hypothetical protein  31.15 
 
 		 134 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861722  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0809  protein of unknown function DUF1469  31.65 
 
 		 142 aa  48.1  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2275  hypothetical protein  31.15 
 
 		 134 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4843  protein of unknown function DUF1469  42.17 
 
 		 144 aa  45.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2073  protein of unknown function DUF1469  36.8 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01420  Protein of unknown function (DUF1469)  27.69 
 
 		 155 aa  44.3  0.0008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1384  protein of unknown function DUF1469  31.82 
 
 		 148 aa  41.6  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000799445  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3353  protein of unknown function DUF1469  30.89 
 
 		 145 aa  41.2  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>