51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0512 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0512  protein of unknown function DUF1469  100 
 
 
175 aa  347  6e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3925  protein of unknown function DUF1469  46.27 
 
 
171 aa  119  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.962598  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1378  hypothetical protein  50 
 
 
169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0194818  normal  0.100632 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5428  hypothetical protein  41.14 
 
 
175 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36060  Protein of unknown function (DUF1469)  45.83 
 
 
169 aa  108  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328772  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13700  transmembrane protein  42.25 
 
 
172 aa  102  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0470389 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0260  protein of unknown function DUF1469  43.33 
 
 
155 aa  102  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.864061  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4811  hypothetical protein  45.52 
 
 
170 aa  94.7  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.674359  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4897  hypothetical protein  45.52 
 
 
170 aa  94.7  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.912667  normal  0.0700179 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5198  hypothetical protein  45.52 
 
 
170 aa  94.4  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0142568  hitchhiker  0.000165751 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0724  protein of unknown function DUF1469  36.99 
 
 
158 aa  93.6  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01420  Protein of unknown function (DUF1469)  38.19 
 
 
155 aa  80.9  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0525  protein of unknown function DUF1469  40 
 
 
168 aa  80.1  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.822053  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0555  protein of unknown function DUF1469  37.5 
 
 
180 aa  78.2  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000647144 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25370  Protein of unknown function (DUF1469)  36.07 
 
 
155 aa  71.2  0.000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0344  hypothetical protein  35.43 
 
 
139 aa  71.2  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1321  protein of unknown function DUF1469  33.54 
 
 
175 aa  68.6  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0561  protein of unknown function DUF1469  34.48 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0051  protein of unknown function DUF1469  34.48 
 
 
142 aa  67  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4294  hypothetical protein  34.36 
 
 
248 aa  65.1  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.121888  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0417  protein of unknown function DUF1469  38.66 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0343446  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6022  hypothetical protein  37.98 
 
 
156 aa  63.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0210  hypothetical protein  34.78 
 
 
156 aa  62.4  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0321  hypothetical protein  35.38 
 
 
163 aa  62  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.202745  normal  0.194337 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0347  hypothetical protein  31.9 
 
 
140 aa  61.2  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1772  hypothetical protein  40.43 
 
 
151 aa  60.8  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2992  hypothetical protein  32 
 
 
146 aa  59.7  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3084  protein of unknown function DUF1469  34.35 
 
 
138 aa  60.1  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4481  protein of unknown function DUF1469  31.45 
 
 
157 aa  58.5  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.105215 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0221  hypothetical protein  35.56 
 
 
202 aa  58.5  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.253727 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1759  hypothetical protein  36.29 
 
 
151 aa  58.2  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0234108 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0131  hypothetical protein  27.2 
 
 
153 aa  57  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.241414  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2340  protein of unknown function DUF1469  33.04 
 
 
157 aa  57  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2903  protein of unknown function DUF1469  38.6 
 
 
144 aa  57  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708128  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0809  protein of unknown function DUF1469  34.81 
 
 
142 aa  56.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34040  Protein of unknown function (DUF1469)  36.21 
 
 
140 aa  56.6  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0475  hypothetical protein  33.61 
 
 
157 aa  55.5  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2283  hypothetical protein  35.71 
 
 
134 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.122746  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2236  hypothetical protein  35.71 
 
 
134 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861722  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2275  hypothetical protein  35.71 
 
 
134 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0932  hypothetical protein  39.24 
 
 
133 aa  51.2  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6667  hypothetical protein  37.93 
 
 
193 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126358  normal  0.676846 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2073  protein of unknown function DUF1469  37.93 
 
 
137 aa  49.3  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12680  Protein of unknown function (DUF1469)  32.17 
 
 
160 aa  48.9  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4774  protein of unknown function DUF1469  37.5 
 
 
151 aa  48.5  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.487422  normal  0.301166 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5332  protein of unknown function DUF1469  31.54 
 
 
158 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.113739 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27570  Protein of unknown function (DUF1469)  29.6 
 
 
138 aa  46.2  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4843  protein of unknown function DUF1469  38.37 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3353  protein of unknown function DUF1469  35.11 
 
 
145 aa  43.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2137  hypothetical protein  33.61 
 
 
133 aa  42.4  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.375802  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3512  protein of unknown function DUF1469  43.69 
 
 
132 aa  40.8  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.377984 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>