63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3512 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3512  protein of unknown function DUF1469  100 
 
 
132 aa  246  8e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.377984 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4481  protein of unknown function DUF1469  50.82 
 
 
157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.105215 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34040  Protein of unknown function (DUF1469)  50.79 
 
 
140 aa  108  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1772  hypothetical protein  47.86 
 
 
151 aa  102  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3084  protein of unknown function DUF1469  40 
 
 
138 aa  92.8  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2340  protein of unknown function DUF1469  41.6 
 
 
157 aa  92  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1759  hypothetical protein  46.09 
 
 
151 aa  90.1  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0234108 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3353  protein of unknown function DUF1469  50.79 
 
 
145 aa  89.7  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0932  hypothetical protein  42.86 
 
 
133 aa  82.8  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2275  hypothetical protein  42.62 
 
 
134 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27570  Protein of unknown function (DUF1469)  39.84 
 
 
138 aa  79  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2137  hypothetical protein  38.17 
 
 
133 aa  77.8  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.375802  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2283  hypothetical protein  41.8 
 
 
134 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.122746  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2236  hypothetical protein  41.8 
 
 
134 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861722  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2903  protein of unknown function DUF1469  41.94 
 
 
144 aa  72  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708128  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1993  protein of unknown function DUF1469  44.63 
 
 
137 aa  70.5  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.122307  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4774  protein of unknown function DUF1469  48.31 
 
 
151 aa  70.1  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.487422  normal  0.301166 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2992  hypothetical protein  38.71 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4218  protein of unknown function DUF1469  40.16 
 
 
132 aa  63.5  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0334  hypothetical protein  40.8 
 
 
134 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25370  Protein of unknown function (DUF1469)  40 
 
 
155 aa  62  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0724  protein of unknown function DUF1469  36.28 
 
 
158 aa  62  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0555  protein of unknown function DUF1469  38.33 
 
 
180 aa  61.2  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000647144 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2073  protein of unknown function DUF1469  39.55 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6344  hypothetical protein  45.38 
 
 
133 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.443827  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1591  hypothetical protein  36.15 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0051  protein of unknown function DUF1469  37.63 
 
 
142 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0561  protein of unknown function DUF1469  37.63 
 
 
142 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1321  protein of unknown function DUF1469  40 
 
 
175 aa  54.7  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6022  hypothetical protein  32.52 
 
 
156 aa  54.7  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5621  protein of unknown function DUF1469  33.08 
 
 
138 aa  53.5  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.182455 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0221  hypothetical protein  35.29 
 
 
202 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.253727 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1342  hypothetical protein  38.52 
 
 
308 aa  53.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.255297  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0809  protein of unknown function DUF1469  33.88 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06670  Protein of unknown function (DUF1469)  33.83 
 
 
307 aa  49.7  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6549  protein of unknown function DUF1469  31.78 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0142295  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13700  transmembrane protein  25.81 
 
 
172 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0470389 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36060  Protein of unknown function (DUF1469)  32.5 
 
 
169 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328772  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0344  hypothetical protein  38.1 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4843  protein of unknown function DUF1469  40.16 
 
 
135 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0258139  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34600  hypothetical protein  33.62 
 
 
120 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0475  hypothetical protein  39.25 
 
 
157 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01420  Protein of unknown function (DUF1469)  38.24 
 
 
155 aa  47.8  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0347  hypothetical protein  31.37 
 
 
140 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1814  protein of unknown function DUF1469  46.72 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000011426  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5428  hypothetical protein  30.39 
 
 
175 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3925  protein of unknown function DUF1469  27.64 
 
 
171 aa  45.4  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.962598  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0417  protein of unknown function DUF1469  36.47 
 
 
165 aa  45.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0343446  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1378  protein of unknown function DUF1469  39.05 
 
 
284 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000017645 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1378  hypothetical protein  29.93 
 
 
169 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0194818  normal  0.100632 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4897  hypothetical protein  36.71 
 
 
170 aa  43.9  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.912667  normal  0.0700179 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4811  hypothetical protein  36.71 
 
 
170 aa  43.9  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.674359  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5198  hypothetical protein  36.71 
 
 
170 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0142568  hitchhiker  0.000165751 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0178  hypothetical protein  29.69 
 
 
149 aa  42.7  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11370  Protein of unknown function (DUF1469)  48.41 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3054  hypothetical protein  31.03 
 
 
145 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0916548  normal  0.287496 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0512  protein of unknown function DUF1469  43.69 
 
 
175 aa  41.6  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0131  hypothetical protein  32.67 
 
 
153 aa  41.6  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.241414  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0321  hypothetical protein  39.39 
 
 
163 aa  40.8  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.202745  normal  0.194337 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2383  putative integral membrane protein  38.78 
 
 
133 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0168516  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1045  hypothetical protein  38.78 
 
 
133 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0593921  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4294  hypothetical protein  43.64 
 
 
248 aa  40  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.121888  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2902  hypothetical protein  30.83 
 
 
143 aa  40.4  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.694207  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>