68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_11370 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_11370  Protein of unknown function (DUF1469)  100 
 
 		 137 aa  258  1e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1772  hypothetical protein  50 
 
 		 151 aa  116  7.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2340  protein of unknown function DUF1469  44.96 
 
 		 157 aa  110  7.000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1759  hypothetical protein  50.85 
 
 		 151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0234108 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3353  protein of unknown function DUF1469  57.26 
 
 		 145 aa  108  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4481  protein of unknown function DUF1469  41.6 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.105215 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34040  Protein of unknown function (DUF1469)  43.31 
 
 		 140 aa  103  7e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2903  protein of unknown function DUF1469  50 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708128  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2137  hypothetical protein  48.41 
 
 		 133 aa  97.1  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.375802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27570  Protein of unknown function (DUF1469)  47.58 
 
 		 138 aa  95.5  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0932  hypothetical protein  47.2 
 
 		 133 aa  94.7  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3084  protein of unknown function DUF1469  45.9 
 
 		 138 aa  88.6  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4774  protein of unknown function DUF1469  46.97 
 
 		 151 aa  89  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.487422  normal  0.301166 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1993  protein of unknown function DUF1469  53.72 
 
 		 137 aa  89  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.122307  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2236  hypothetical protein  47.93 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2283  hypothetical protein  47.93 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.122746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2275  hypothetical protein  47.93 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6549  protein of unknown function DUF1469  46.15 
 
 		 140 aa  83.6  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0142295  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2073  protein of unknown function DUF1469  45.67 
 
 		 137 aa  80.5  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6344  hypothetical protein  52.07 
 
 		 133 aa  77  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.443827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3512  protein of unknown function DUF1469  50 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.377984 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4218  protein of unknown function DUF1469  41.46 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0334  hypothetical protein  47.9 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1814  protein of unknown function DUF1469  56.45 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000011426  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6022  hypothetical protein  39.2 
 
 		 156 aa  70.5  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2992  hypothetical protein  43.44 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25370  Protein of unknown function (DUF1469)  38.89 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1591  hypothetical protein  36.69 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4843  protein of unknown function DUF1469  43.61 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0258139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0724  protein of unknown function DUF1469  36.63 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0178  hypothetical protein  34.81 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1342  hypothetical protein  34.91 
 
 		 308 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.255297  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0221  hypothetical protein  35.48 
 
 		 202 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.253727 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0809  protein of unknown function DUF1469  34.4 
 
 		 142 aa  50.8  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0417  protein of unknown function DUF1469  34.09 
 
 		 165 aa  51.2  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0343446  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0555  protein of unknown function DUF1469  40.54 
 
 		 180 aa  50.8  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000647144 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1384  protein of unknown function DUF1469  37.39 
 
 		 148 aa  50.8  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000799445  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1378  protein of unknown function DUF1469  33.07 
 
 		 284 aa  50.4  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000017645 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1891  hypothetical protein  38.4 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.373064  normal  0.485358 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06670  Protein of unknown function (DUF1469)  33.64 
 
 		 307 aa  50.1  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1006  hypothetical protein  38.61 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0515851  hitchhiker  0.00247908 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3925  protein of unknown function DUF1469  30.65 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.962598  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1378  hypothetical protein  35.09 
 
 		 169 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0194818  normal  0.100632 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01420  Protein of unknown function (DUF1469)  31.45 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5428  hypothetical protein  33.33 
 
 		 175 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0051  protein of unknown function DUF1469  34.69 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0561  protein of unknown function DUF1469  34.69 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36060  Protein of unknown function (DUF1469)  32.23 
 
 		 169 aa  47.8  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328772  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1045  hypothetical protein  38.4 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0593921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1475  protein of unknown function DUF1469  34.71 
 
 		 129 aa  45.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00110957  normal  0.391002 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13700  transmembrane protein  31.9 
 
 		 172 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0470389 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2383  putative integral membrane protein  38.4 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0168516  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1321  protein of unknown function DUF1469  30.4 
 
 		 175 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0321  hypothetical protein  33.8 
 
 		 163 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.202745  normal  0.194337 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5356  protein of unknown function DUF1469  31.34 
 
 		 171 aa  44.7  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.586134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4815  protein of unknown function DUF1469  35.48 
 
 		 131 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1247  hypothetical protein  33.83 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.391441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12680  Protein of unknown function (DUF1469)  31.88 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0131  hypothetical protein  31.48 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.241414  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4294  hypothetical protein  32.28 
 
 		 248 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.121888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0347  hypothetical protein  34.29 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0344  hypothetical protein  34.17 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4599  hypothetical protein  30.53 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4811  hypothetical protein  36.84 
 
 		 170 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.674359  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4179  hypothetical protein  33.58 
 
 		 136 aa  41.6  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.865834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1438  protein of unknown function DUF1469  46 
 
 		 130 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.157465  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5198  hypothetical protein  36.84 
 
 		 170 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0142568  hitchhiker  0.000165751 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4897  hypothetical protein  36.84 
 
 		 170 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.912667  normal  0.0700179 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>