62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0555 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0555  protein of unknown function DUF1469  100 
 
 
180 aa  346  9e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000647144 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0347  hypothetical protein  63.49 
 
 
140 aa  153  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0051  protein of unknown function DUF1469  63.11 
 
 
142 aa  143  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0561  protein of unknown function DUF1469  63.11 
 
 
142 aa  143  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01420  Protein of unknown function (DUF1469)  52.46 
 
 
155 aa  123  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0809  protein of unknown function DUF1469  49.62 
 
 
142 aa  108  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1321  protein of unknown function DUF1469  47.2 
 
 
175 aa  107  9.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2992  hypothetical protein  43.75 
 
 
146 aa  89.4  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6022  hypothetical protein  36.57 
 
 
156 aa  85.5  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0131  hypothetical protein  32.47 
 
 
153 aa  80.1  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.241414  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0724  protein of unknown function DUF1469  41.35 
 
 
158 aa  77  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4294  hypothetical protein  35.67 
 
 
248 aa  76.6  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.121888  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0221  hypothetical protein  37.11 
 
 
202 aa  74.7  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.253727 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0321  hypothetical protein  43.97 
 
 
163 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.202745  normal  0.194337 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0344  hypothetical protein  32.12 
 
 
139 aa  72  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4481  protein of unknown function DUF1469  35.97 
 
 
157 aa  70.5  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.105215 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5428  hypothetical protein  31.71 
 
 
175 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1378  hypothetical protein  34.88 
 
 
169 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0194818  normal  0.100632 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0210  hypothetical protein  42.11 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13700  transmembrane protein  34.39 
 
 
172 aa  67.8  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0470389 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1772  hypothetical protein  40 
 
 
151 aa  63.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3925  protein of unknown function DUF1469  37.21 
 
 
171 aa  64.3  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.962598  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2340  protein of unknown function DUF1469  36.43 
 
 
157 aa  62.8  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0475  hypothetical protein  38.66 
 
 
157 aa  61.2  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2073  protein of unknown function DUF1469  39.53 
 
 
137 aa  61.2  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0525  protein of unknown function DUF1469  34.03 
 
 
168 aa  59.3  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.822053  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0417  protein of unknown function DUF1469  34.11 
 
 
165 aa  58.5  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0343446  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4811  hypothetical protein  34.81 
 
 
170 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.674359  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4897  hypothetical protein  34.81 
 
 
170 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.912667  normal  0.0700179 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5198  hypothetical protein  34.81 
 
 
170 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0142568  hitchhiker  0.000165751 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3084  protein of unknown function DUF1469  34.68 
 
 
138 aa  57.4  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1759  hypothetical protein  36.36 
 
 
151 aa  56.6  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0234108 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0512  protein of unknown function DUF1469  37.58 
 
 
175 aa  55.8  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25370  Protein of unknown function (DUF1469)  35.09 
 
 
155 aa  55.5  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6667  hypothetical protein  41.04 
 
 
193 aa  55.1  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126358  normal  0.676846 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4232  protein of unknown function DUF1469  53.57 
 
 
145 aa  53.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645637  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2903  protein of unknown function DUF1469  38.02 
 
 
144 aa  53.1  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708128  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2236  hypothetical protein  38.46 
 
 
134 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861722  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2275  hypothetical protein  38.46 
 
 
134 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2283  hypothetical protein  38.46 
 
 
134 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.122746  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1591  hypothetical protein  32.33 
 
 
151 aa  51.2  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2210  hypothetical protein  36.29 
 
 
132 aa  51.2  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.554398  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3353  protein of unknown function DUF1469  45.87 
 
 
145 aa  50.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2383  putative integral membrane protein  34.45 
 
 
133 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0168516  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1045  hypothetical protein  34.45 
 
 
133 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0593921  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5332  protein of unknown function DUF1469  32.84 
 
 
158 aa  48.5  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.113739 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36060  Protein of unknown function (DUF1469)  33.33 
 
 
169 aa  48.5  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328772  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4774  protein of unknown function DUF1469  52.17 
 
 
151 aa  48.1  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.487422  normal  0.301166 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6344  hypothetical protein  51.06 
 
 
133 aa  47.8  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.443827  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27570  Protein of unknown function (DUF1469)  32.54 
 
 
138 aa  47  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0178  hypothetical protein  32.31 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34040  Protein of unknown function (DUF1469)  33.59 
 
 
140 aa  45.8  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12680  Protein of unknown function (DUF1469)  29.1 
 
 
160 aa  45.8  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0334  hypothetical protein  41.67 
 
 
134 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0260  protein of unknown function DUF1469  29.56 
 
 
155 aa  44.7  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.864061  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4843  protein of unknown function DUF1469  36.03 
 
 
144 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3512  protein of unknown function DUF1469  52.78 
 
 
132 aa  44.3  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.377984 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4815  protein of unknown function DUF1469  36.84 
 
 
131 aa  43.9  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3900  putative nutrient deprivation-induced protein  33.83 
 
 
139 aa  42  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0615251  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5356  protein of unknown function DUF1469  29.22 
 
 
171 aa  41.6  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.586134  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1891  hypothetical protein  35.71 
 
 
133 aa  41.2  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.373064  normal  0.485358 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0932  hypothetical protein  45.65 
 
 
133 aa  40.8  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>