28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5332 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5332  protein of unknown function DUF1469  100 
 
 
158 aa  307  2.9999999999999997e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.113739 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0131  hypothetical protein  39.06 
 
 
153 aa  85.9  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.241414  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3925  protein of unknown function DUF1469  36.76 
 
 
171 aa  69.7  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.962598  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0809  protein of unknown function DUF1469  42.11 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0417  protein of unknown function DUF1469  40.18 
 
 
165 aa  62.4  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0343446  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25370  Protein of unknown function (DUF1469)  37.1 
 
 
155 aa  62  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0555  protein of unknown function DUF1469  33.1 
 
 
180 aa  60.5  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000647144 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0724  protein of unknown function DUF1469  37.4 
 
 
158 aa  60.1  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0475  hypothetical protein  36.28 
 
 
157 aa  57.4  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36060  Protein of unknown function (DUF1469)  37.4 
 
 
169 aa  55.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328772  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0210  hypothetical protein  33.58 
 
 
156 aa  55.5  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0051  protein of unknown function DUF1469  33.06 
 
 
142 aa  55.1  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0347  hypothetical protein  30.53 
 
 
140 aa  55.1  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0561  protein of unknown function DUF1469  33.06 
 
 
142 aa  54.3  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0344  hypothetical protein  36.94 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0178  hypothetical protein  33.09 
 
 
149 aa  53.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1006  hypothetical protein  35.64 
 
 
149 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0515851  hitchhiker  0.00247908 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4843  protein of unknown function DUF1469  41.94 
 
 
144 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4294  hypothetical protein  34.16 
 
 
248 aa  51.2  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.121888  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01420  Protein of unknown function (DUF1469)  35.29 
 
 
155 aa  48.9  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0221  hypothetical protein  37.07 
 
 
202 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.253727 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1378  hypothetical protein  33.61 
 
 
169 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0194818  normal  0.100632 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5428  hypothetical protein  32.5 
 
 
175 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4481  protein of unknown function DUF1469  35.79 
 
 
157 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.105215 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6022  hypothetical protein  28.87 
 
 
156 aa  44.3  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12680  Protein of unknown function (DUF1469)  31.94 
 
 
160 aa  43.5  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2992  hypothetical protein  31.43 
 
 
146 aa  42.4  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1759  hypothetical protein  34.95 
 
 
151 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0234108 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>