51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0344 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0344  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  276  5e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4294  hypothetical protein  33.61 
 
 		 248 aa  82  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.121888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5428  hypothetical protein  36.89 
 
 		 175 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0321  hypothetical protein  38.79 
 
 		 163 aa  80.5  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.202745  normal  0.194337 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0724  protein of unknown function DUF1469  38.46 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1378  hypothetical protein  34.68 
 
 		 169 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0194818  normal  0.100632 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0417  protein of unknown function DUF1469  40 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0343446  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0555  protein of unknown function DUF1469  32.12 
 
 		 180 aa  73.2  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000647144 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3925  protein of unknown function DUF1469  34.4 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.962598  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0475  hypothetical protein  44.72 
 
 		 157 aa  71.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0561  protein of unknown function DUF1469  33.61 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0051  protein of unknown function DUF1469  33.61 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6022  hypothetical protein  35.4 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0347  hypothetical protein  30.77 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4897  hypothetical protein  36.07 
 
 		 170 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.912667  normal  0.0700179 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4811  hypothetical protein  36.07 
 
 		 170 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.674359  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36060  Protein of unknown function (DUF1469)  33.85 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328772  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5198  hypothetical protein  36.07 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0142568  hitchhiker  0.000165751 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0260  protein of unknown function DUF1469  34.13 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.864061  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13700  transmembrane protein  27.64 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0470389 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0210  hypothetical protein  40.87 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1321  protein of unknown function DUF1469  32.03 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2992  hypothetical protein  32.26 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0525  protein of unknown function DUF1469  40.5 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.822053  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25370  Protein of unknown function (DUF1469)  35.16 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2340  protein of unknown function DUF1469  34.26 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3084  protein of unknown function DUF1469  35.59 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4481  protein of unknown function DUF1469  32.14 
 
 		 157 aa  57  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.105215 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0512  protein of unknown function DUF1469  35.43 
 
 		 175 aa  53.9  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0221  hypothetical protein  31.71 
 
 		 202 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.253727 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0809  protein of unknown function DUF1469  29.5 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2073  protein of unknown function DUF1469  36.15 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34040  Protein of unknown function (DUF1469)  37.93 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01420  Protein of unknown function (DUF1469)  26.52 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1772  hypothetical protein  30.58 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0131  hypothetical protein  32.23 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.241414  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1759  hypothetical protein  32.41 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0234108 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0932  hypothetical protein  39.68 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12680  Protein of unknown function (DUF1469)  28.24 
 
 		 160 aa  47  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2903  protein of unknown function DUF1469  34.19 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4843  protein of unknown function DUF1469  38.82 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5332  protein of unknown function DUF1469  41.18 
 
 		 158 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.113739 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1552  hypothetical protein  32.5 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1831  protein of unknown function DUF1469  32.5 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.371829 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1689  protein of unknown function DUF1469  33.33 
 
 		 138 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0178  hypothetical protein  28.8 
 
 		 149 aa  43.9  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6667  hypothetical protein  36.52 
 
 		 193 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126358  normal  0.676846 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2283  hypothetical protein  38.89 
 
 		 134 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.122746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2236  hypothetical protein  38.89 
 
 		 134 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861722  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1483  hypothetical protein  31.21 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000255218 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3560  hypothetical protein  31.03 
 
 		 134 aa  40  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.462126  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>