32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1689 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1689  protein of unknown function DUF1469  100 
 
 
138 aa  265  1e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1552  hypothetical protein  97.56 
 
 
140 aa  230  5e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1831  protein of unknown function DUF1469  97.56 
 
 
135 aa  229  6e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.371829 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1483  hypothetical protein  63.77 
 
 
145 aa  148  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000255218 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6820  hypothetical protein  68.99 
 
 
131 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7553  protein of unknown function DUF1469  67.44 
 
 
131 aa  136  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0520584  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4815  protein of unknown function DUF1469  52.21 
 
 
131 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1300  hypothetical protein  37.4 
 
 
129 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.726598  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1591  hypothetical protein  30.5 
 
 
151 aa  61.6  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3560  hypothetical protein  31.58 
 
 
134 aa  59.7  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.462126  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7599  protein of unknown function DUF1469  33.64 
 
 
121 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34040  Protein of unknown function (DUF1469)  31.78 
 
 
140 aa  52.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0344  hypothetical protein  32.82 
 
 
139 aa  51.2  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1045  hypothetical protein  33.59 
 
 
133 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0593921  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0407  putative integral membrane protein  28.57 
 
 
141 aa  50.4  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.131115 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2383  putative integral membrane protein  33.59 
 
 
133 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0168516  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2340  protein of unknown function DUF1469  28.23 
 
 
157 aa  48.1  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0417  protein of unknown function DUF1469  37.21 
 
 
165 aa  47.8  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0343446  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3869  hypothetical protein  33.07 
 
 
130 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.748627  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1247  hypothetical protein  33.07 
 
 
129 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.391441  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5621  protein of unknown function DUF1469  30.71 
 
 
138 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.182455 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0260  protein of unknown function DUF1469  28.77 
 
 
155 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.864061  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0131  hypothetical protein  32.11 
 
 
153 aa  46.2  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.241414  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2210  hypothetical protein  33.59 
 
 
132 aa  44.7  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.554398  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1891  hypothetical protein  33.59 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.373064  normal  0.485358 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3084  protein of unknown function DUF1469  29.55 
 
 
138 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4179  hypothetical protein  27.69 
 
 
136 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.865834  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3142  hypothetical protein  35.04 
 
 
131 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25370  Protein of unknown function (DUF1469)  28.93 
 
 
155 aa  41.6  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4599  hypothetical protein  26.98 
 
 
130 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1378  hypothetical protein  27.72 
 
 
169 aa  40.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0194818  normal  0.100632 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13700  transmembrane protein  28.04 
 
 
172 aa  40  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0470389 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>