56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1891 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1891  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  245  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.373064  normal  0.485358 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2383  putative integral membrane protein  84.96 
 
 		 133 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0168516  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1045  hypothetical protein  84.96 
 
 		 133 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0593921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1591  hypothetical protein  39.71 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2210  hypothetical protein  45.3 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.554398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3560  hypothetical protein  38.52 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.462126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34600  hypothetical protein  35.34 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2992  hypothetical protein  36.36 
 
 		 146 aa  62  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4481  protein of unknown function DUF1469  30.95 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.105215 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27570  Protein of unknown function (DUF1469)  39.26 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6022  hypothetical protein  35.71 
 
 		 156 aa  60.1  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1438  protein of unknown function DUF1469  40 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.157465  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1772  hypothetical protein  39.06 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34040  Protein of unknown function (DUF1469)  38.93 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1689  protein of unknown function DUF1469  33.88 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2073  protein of unknown function DUF1469  39.34 
 
 		 137 aa  57  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3142  hypothetical protein  47.97 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1552  hypothetical protein  34.71 
 
 		 140 aa  57  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1831  protein of unknown function DUF1469  34.71 
 
 		 135 aa  57  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.371829 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1321  protein of unknown function DUF1469  32.2 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4815  protein of unknown function DUF1469  38.21 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0561  protein of unknown function DUF1469  34.62 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5621  protein of unknown function DUF1469  33.33 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.182455 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0555  protein of unknown function DUF1469  35.71 
 
 		 180 aa  54.3  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000647144 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0809  protein of unknown function DUF1469  30.77 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0051  protein of unknown function DUF1469  34.62 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1759  hypothetical protein  37.5 
 
 		 151 aa  53.5  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0234108 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4599  hypothetical protein  33.87 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5260  nutrient deprivation-induced protein  33.33 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0347  hypothetical protein  31.13 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0221  hypothetical protein  33.85 
 
 		 202 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.253727 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4179  hypothetical protein  32.58 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.865834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3900  putative nutrient deprivation-induced protein  34.59 
 
 		 139 aa  52  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0615251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1483  hypothetical protein  35.94 
 
 		 145 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000255218 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3869  hypothetical protein  34.4 
 
 		 130 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.748627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0407  putative integral membrane protein  33.61 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.131115 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01420  Protein of unknown function (DUF1469)  30.08 
 
 		 155 aa  51.6  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3353  protein of unknown function DUF1469  35.43 
 
 		 145 aa  50.4  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3084  protein of unknown function DUF1469  31.71 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0178  hypothetical protein  31.75 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1247  hypothetical protein  32.56 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.391441  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2137  hypothetical protein  37.1 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.375802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3054  hypothetical protein  39.82 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0916548  normal  0.287496 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0417  protein of unknown function DUF1469  36.25 
 
 		 165 aa  45.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0343446  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1384  protein of unknown function DUF1469  36 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000799445  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2275  hypothetical protein  30.83 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2903  protein of unknown function DUF1469  39.66 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7553  protein of unknown function DUF1469  39.34 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0520584  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2236  hypothetical protein  30.83 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861722  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2340  protein of unknown function DUF1469  30.89 
 
 		 157 aa  42.4  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2283  hypothetical protein  30.83 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.122746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4294  hypothetical protein  36.59 
 
 		 248 aa  41.2  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.121888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1378  hypothetical protein  30.16 
 
 		 169 aa  40.8  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0194818  normal  0.100632 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06670  Protein of unknown function (DUF1469)  30.15 
 
 		 307 aa  40.4  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0932  hypothetical protein  32.77 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0334  hypothetical protein  37.5 
 
 		 134 aa  40.4  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>