42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1384 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1384  protein of unknown function DUF1469  100 
 
 		 148 aa  293  6e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000799445  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2992  hypothetical protein  40.8 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6022  hypothetical protein  37.7 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0221  hypothetical protein  35 
 
 		 202 aa  67  0.00000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.253727 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27570  Protein of unknown function (DUF1469)  36.67 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1591  hypothetical protein  38.46 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1006  hypothetical protein  38.33 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0515851  hitchhiker  0.00247908 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2073  protein of unknown function DUF1469  40.48 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4481  protein of unknown function DUF1469  31.2 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.105215 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25370  Protein of unknown function (DUF1469)  30.08 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1772  hypothetical protein  39.47 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0809  protein of unknown function DUF1469  35.54 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1993  protein of unknown function DUF1469  41.03 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.122307  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3353  protein of unknown function DUF1469  36.57 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3084  protein of unknown function DUF1469  31.58 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6667  hypothetical protein  34.92 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126358  normal  0.676846 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1759  hypothetical protein  36.84 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0234108 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0051  protein of unknown function DUF1469  32.28 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0561  protein of unknown function DUF1469  32.28 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2275  hypothetical protein  39.52 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2340  protein of unknown function DUF1469  33.33 
 
 		 157 aa  51.2  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1321  protein of unknown function DUF1469  31.36 
 
 		 175 aa  50.8  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0347  hypothetical protein  35.65 
 
 		 140 aa  50.4  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34600  hypothetical protein  32.11 
 
 		 120 aa  50.4  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34040  Protein of unknown function (DUF1469)  32.23 
 
 		 140 aa  50.1  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5356  protein of unknown function DUF1469  33.33 
 
 		 171 aa  48.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.586134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2236  hypothetical protein  39.52 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2283  hypothetical protein  39.52 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.122746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12680  Protein of unknown function (DUF1469)  34.04 
 
 		 160 aa  48.9  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0555  protein of unknown function DUF1469  34.82 
 
 		 180 aa  48.1  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000647144 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3054  hypothetical protein  38.05 
 
 		 145 aa  47.8  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0916548  normal  0.287496 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4774  protein of unknown function DUF1469  31.75 
 
 		 151 aa  47.4  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.487422  normal  0.301166 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1045  hypothetical protein  38.1 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0593921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2383  putative integral membrane protein  38.1 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0168516  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3512  protein of unknown function DUF1469  41.03 
 
 		 132 aa  47.4  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.377984 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36060  Protein of unknown function (DUF1469)  35.56 
 
 		 169 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328772  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0334  hypothetical protein  37.39 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4232  protein of unknown function DUF1469  37.82 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645637  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2903  protein of unknown function DUF1469  36.61 
 
 		 144 aa  43.5  0.0009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0932  hypothetical protein  28.7 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4294  hypothetical protein  28.35 
 
 		 248 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.121888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4218  protein of unknown function DUF1469  33.05 
 
 		 132 aa  40.4  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>