67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2340 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2340  protein of unknown function DUF1469  100 
 
 
157 aa  313  4e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34040  Protein of unknown function (DUF1469)  51.45 
 
 
140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1772  hypothetical protein  50.39 
 
 
151 aa  121  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1759  hypothetical protein  47.86 
 
 
151 aa  117  7.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0234108 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4481  protein of unknown function DUF1469  40.4 
 
 
157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.105215 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3353  protein of unknown function DUF1469  48.91 
 
 
145 aa  98.2  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0932  hypothetical protein  42.86 
 
 
133 aa  97.1  9e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2283  hypothetical protein  49.17 
 
 
134 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.122746  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2236  hypothetical protein  49.17 
 
 
134 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861722  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2275  hypothetical protein  49.17 
 
 
134 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2903  protein of unknown function DUF1469  42.28 
 
 
144 aa  87.4  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708128  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3084  protein of unknown function DUF1469  39.67 
 
 
138 aa  85.5  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6344  hypothetical protein  46.67 
 
 
133 aa  80.5  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.443827  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0334  hypothetical protein  46.77 
 
 
134 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27570  Protein of unknown function (DUF1469)  38.35 
 
 
138 aa  77.4  0.00000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2137  hypothetical protein  37.5 
 
 
133 aa  77.4  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.375802  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4774  protein of unknown function DUF1469  42.03 
 
 
151 aa  77  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.487422  normal  0.301166 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6549  protein of unknown function DUF1469  37.4 
 
 
140 aa  73.9  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0142295  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2073  protein of unknown function DUF1469  40.88 
 
 
137 aa  73.2  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0724  protein of unknown function DUF1469  31.25 
 
 
158 aa  69.3  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4218  protein of unknown function DUF1469  38.98 
 
 
132 aa  66.2  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0051  protein of unknown function DUF1469  36 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0561  protein of unknown function DUF1469  36 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6022  hypothetical protein  36.51 
 
 
156 aa  63.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3512  protein of unknown function DUF1469  41.6 
 
 
132 aa  62.8  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.377984 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0347  hypothetical protein  36.21 
 
 
140 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0555  protein of unknown function DUF1469  36.43 
 
 
180 aa  62.8  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000647144 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1993  protein of unknown function DUF1469  39.39 
 
 
137 aa  62  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.122307  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2992  hypothetical protein  32.37 
 
 
146 aa  62  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0809  protein of unknown function DUF1469  35.25 
 
 
142 aa  59.3  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01420  Protein of unknown function (DUF1469)  27.81 
 
 
155 aa  58.5  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0344  hypothetical protein  34.26 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12680  Protein of unknown function (DUF1469)  33.8 
 
 
160 aa  57.8  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1321  protein of unknown function DUF1469  32.21 
 
 
175 aa  56.6  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1378  hypothetical protein  33.59 
 
 
169 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0194818  normal  0.100632 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5428  hypothetical protein  33.59 
 
 
175 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3560  hypothetical protein  37.7 
 
 
134 aa  56.2  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.462126  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1814  protein of unknown function DUF1469  46.67 
 
 
142 aa  55.5  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000011426  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3925  protein of unknown function DUF1469  33.87 
 
 
171 aa  55.5  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.962598  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4179  hypothetical protein  33.05 
 
 
136 aa  54.7  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.865834  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13700  transmembrane protein  31.2 
 
 
172 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0470389 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0417  protein of unknown function DUF1469  34.15 
 
 
165 aa  53.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0343446  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0221  hypothetical protein  29.17 
 
 
202 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.253727 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4294  hypothetical protein  33.08 
 
 
248 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.121888  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25370  Protein of unknown function (DUF1469)  30 
 
 
155 aa  52.4  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4843  protein of unknown function DUF1469  37.5 
 
 
135 aa  52.4  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0258139  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36060  Protein of unknown function (DUF1469)  29.6 
 
 
169 aa  52.4  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328772  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1591  hypothetical protein  34.48 
 
 
151 aa  51.2  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0260  protein of unknown function DUF1469  33.33 
 
 
155 aa  50.8  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.864061  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0178  hypothetical protein  31.71 
 
 
149 aa  50.8  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5198  hypothetical protein  36.89 
 
 
170 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0142568  hitchhiker  0.000165751 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4897  hypothetical protein  36.89 
 
 
170 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.912667  normal  0.0700179 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4811  hypothetical protein  36.89 
 
 
170 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.674359  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5356  protein of unknown function DUF1469  32.54 
 
 
171 aa  48.1  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.586134  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1552  hypothetical protein  29.27 
 
 
140 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1831  protein of unknown function DUF1469  29.27 
 
 
135 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.371829 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06670  Protein of unknown function (DUF1469)  30.88 
 
 
307 aa  47  0.00009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11370  Protein of unknown function (DUF1469)  44.96 
 
 
137 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0521  hypothetical protein  27.1 
 
 
270 aa  46.2  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.16509  normal  0.532101 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2210  hypothetical protein  34.15 
 
 
132 aa  45.1  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.554398  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1689  protein of unknown function DUF1469  28.83 
 
 
138 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0321  hypothetical protein  29.37 
 
 
163 aa  44.3  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.202745  normal  0.194337 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1342  hypothetical protein  31.82 
 
 
308 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.255297  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1006  hypothetical protein  36.73 
 
 
149 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0515851  hitchhiker  0.00247908 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0525  protein of unknown function DUF1469  36.23 
 
 
168 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.822053  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34600  hypothetical protein  26.72 
 
 
120 aa  41.2  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2259  hypothetical protein  28.68 
 
 
159 aa  40.8  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.480389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>