41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_4179 on replicon NC_009959
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009959  Dshi_4179  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  259  1e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.865834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4815  protein of unknown function DUF1469  36.8 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2340  protein of unknown function DUF1469  33.05 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3084  protein of unknown function DUF1469  36.8 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4481  protein of unknown function DUF1469  34.81 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.105215 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1591  hypothetical protein  37.41 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1759  hypothetical protein  39.2 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0234108 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3560  hypothetical protein  35.07 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.462126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1772  hypothetical protein  38.76 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4599  hypothetical protein  32.54 
 
 		 130 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6549  protein of unknown function DUF1469  36.84 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0142295  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3869  hypothetical protein  31.45 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.748627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27570  Protein of unknown function (DUF1469)  33.83 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34040  Protein of unknown function (DUF1469)  33.33 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2210  hypothetical protein  34.13 
 
 		 132 aa  50.8  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.554398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2992  hypothetical protein  32.2 
 
 		 146 aa  50.4  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2137  hypothetical protein  36.75 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.375802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2073  protein of unknown function DUF1469  33.33 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7553  protein of unknown function DUF1469  36 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0520584  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1045  hypothetical protein  31.16 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0593921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2383  putative integral membrane protein  31.16 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0168516  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5621  protein of unknown function DUF1469  28.36 
 
 		 138 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.182455 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1552  hypothetical protein  28.81 
 
 		 140 aa  47  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1831  protein of unknown function DUF1469  28.81 
 
 		 135 aa  47  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.371829 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1689  protein of unknown function DUF1469  28.45 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6820  hypothetical protein  36 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3353  protein of unknown function DUF1469  35.38 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0131  hypothetical protein  34.26 
 
 		 153 aa  45.1  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.241414  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1342  hypothetical protein  36.79 
 
 		 308 aa  44.3  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.255297  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0221  hypothetical protein  31.25 
 
 		 202 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.253727 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1891  hypothetical protein  32.58 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.373064  normal  0.485358 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5260  nutrient deprivation-induced protein  29.84 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1378  hypothetical protein  30.89 
 
 		 169 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0194818  normal  0.100632 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0051  protein of unknown function DUF1469  31.73 
 
 		 142 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0809  protein of unknown function DUF1469  29.41 
 
 		 142 aa  41.6  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0561  protein of unknown function DUF1469  30.77 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1438  protein of unknown function DUF1469  30.65 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.157465  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0347  hypothetical protein  30.77 
 
 		 140 aa  40.8  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3878  hypothetical protein  31.03 
 
 		 131 aa  40.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.716332  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01420  Protein of unknown function (DUF1469)  33.33 
 
 		 155 aa  40.4  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0521  hypothetical protein  31.11 
 
 		 270 aa  40.4  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.16509  normal  0.532101 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>