56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0475 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0475  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  310  6.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0210  hypothetical protein  64.14 
 
 
156 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0344  hypothetical protein  44.72 
 
 
139 aa  90.5  7e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0131  hypothetical protein  41.88 
 
 
153 aa  87  9e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.241414  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0724  protein of unknown function DUF1469  36.67 
 
 
158 aa  75.1  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4843  protein of unknown function DUF1469  47.78 
 
 
144 aa  74.7  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0347  hypothetical protein  38.17 
 
 
140 aa  74.7  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0555  protein of unknown function DUF1469  38.66 
 
 
180 aa  74.3  0.0000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000647144 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0051  protein of unknown function DUF1469  40.5 
 
 
142 aa  74.3  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13700  transmembrane protein  31.65 
 
 
172 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0470389 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0561  protein of unknown function DUF1469  39.67 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5428  hypothetical protein  31.37 
 
 
175 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0417  protein of unknown function DUF1469  38.71 
 
 
165 aa  70.1  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0343446  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2992  hypothetical protein  36.07 
 
 
146 aa  68.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1378  hypothetical protein  31.5 
 
 
169 aa  67.8  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0194818  normal  0.100632 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0809  protein of unknown function DUF1469  41.74 
 
 
142 aa  67.4  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6022  hypothetical protein  40.19 
 
 
156 aa  67  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3925  protein of unknown function DUF1469  37.31 
 
 
171 aa  66.2  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.962598  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0321  hypothetical protein  32.48 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.202745  normal  0.194337 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4294  hypothetical protein  34.48 
 
 
248 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.121888  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36060  Protein of unknown function (DUF1469)  36.97 
 
 
169 aa  62.4  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328772  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4897  hypothetical protein  34.04 
 
 
170 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.912667  normal  0.0700179 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4811  hypothetical protein  34.04 
 
 
170 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.674359  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4481  protein of unknown function DUF1469  35.58 
 
 
157 aa  61.2  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.105215 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5198  hypothetical protein  34.04 
 
 
170 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0142568  hitchhiker  0.000165751 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01420  Protein of unknown function (DUF1469)  35.2 
 
 
155 aa  60.1  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34040  Protein of unknown function (DUF1469)  42.45 
 
 
140 aa  60.1  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1772  hypothetical protein  38.68 
 
 
151 aa  58.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0525  protein of unknown function DUF1469  41.18 
 
 
168 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.822053  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0178  hypothetical protein  37.17 
 
 
149 aa  57  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12680  Protein of unknown function (DUF1469)  36.61 
 
 
160 aa  57  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1759  hypothetical protein  39.6 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0234108 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2903  protein of unknown function DUF1469  42.86 
 
 
144 aa  56.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708128  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2340  protein of unknown function DUF1469  35.64 
 
 
157 aa  55.8  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27570  Protein of unknown function (DUF1469)  37.8 
 
 
138 aa  54.7  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0260  protein of unknown function DUF1469  33.33 
 
 
155 aa  54.7  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.864061  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1321  protein of unknown function DUF1469  31.9 
 
 
175 aa  54.3  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2073  protein of unknown function DUF1469  41.75 
 
 
137 aa  53.9  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25370  Protein of unknown function (DUF1469)  34.29 
 
 
155 aa  53.9  0.0000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3353  protein of unknown function DUF1469  37.04 
 
 
145 aa  52.4  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5332  protein of unknown function DUF1469  36.28 
 
 
158 aa  51.2  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.113739 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0334  hypothetical protein  49.15 
 
 
134 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3084  protein of unknown function DUF1469  34.62 
 
 
138 aa  50.8  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0932  hypothetical protein  40.24 
 
 
133 aa  50.4  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6549  protein of unknown function DUF1469  38.18 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0142295  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0221  hypothetical protein  33.33 
 
 
202 aa  47  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.253727 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4774  protein of unknown function DUF1469  43.96 
 
 
151 aa  44.7  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.487422  normal  0.301166 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0512  protein of unknown function DUF1469  33.61 
 
 
175 aa  45.1  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2275  hypothetical protein  33.61 
 
 
134 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0521  hypothetical protein  33.33 
 
 
270 aa  44.3  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.16509  normal  0.532101 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2236  hypothetical protein  33.61 
 
 
134 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2283  hypothetical protein  33.61 
 
 
134 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.122746  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2210  hypothetical protein  34.62 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.554398  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1591  hypothetical protein  31.39 
 
 
151 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6344  hypothetical protein  44.9 
 
 
133 aa  42.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.443827  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4599  hypothetical protein  32.71 
 
 
130 aa  40.8  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>