17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4347 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4347  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  288  2e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1591  hypothetical protein  32.59 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6022  hypothetical protein  30.88 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34600  hypothetical protein  31.45 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5260  nutrient deprivation-induced protein  31.65 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3900  putative nutrient deprivation-induced protein  30.77 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0615251  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5621  protein of unknown function DUF1469  29.63 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.182455 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0809  protein of unknown function DUF1469  34.56 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4774  protein of unknown function DUF1469  33.33 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.487422  normal  0.301166 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2992  hypothetical protein  29.63 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0221  hypothetical protein  25.18 
 
 		 202 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.253727 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2073  protein of unknown function DUF1469  29.01 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6667  hypothetical protein  25.33 
 
 		 193 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126358  normal  0.676846 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34040  Protein of unknown function (DUF1469)  29.63 
 
 		 140 aa  42  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2275  hypothetical protein  30.5 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3925  protein of unknown function DUF1469  26.99 
 
 		 171 aa  40.8  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.962598  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3084  protein of unknown function DUF1469  27.74 
 
 		 138 aa  40.4  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>