24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1019 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1019  protein of unknown function DUF1469  100 
 
 
150 aa  288  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00635959  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0961  hypothetical protein  99.33 
 
 
150 aa  286  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1022  protein of unknown function DUF1469  98.67 
 
 
150 aa  285  2e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1006  hypothetical protein  69.34 
 
 
149 aa  186  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0515851  hitchhiker  0.00247908 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25370  Protein of unknown function (DUF1469)  36.67 
 
 
155 aa  61.6  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0178  hypothetical protein  36.09 
 
 
149 aa  52.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4481  protein of unknown function DUF1469  38.89 
 
 
157 aa  50.4  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.105215 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0051  protein of unknown function DUF1469  37.29 
 
 
142 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0561  protein of unknown function DUF1469  37.29 
 
 
142 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0221  hypothetical protein  39.74 
 
 
202 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.253727 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0417  protein of unknown function DUF1469  38.74 
 
 
165 aa  48.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0343446  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0724  protein of unknown function DUF1469  32.88 
 
 
158 aa  47  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1321  protein of unknown function DUF1469  44.3 
 
 
175 aa  46.2  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3084  protein of unknown function DUF1469  40.48 
 
 
138 aa  46.2  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0809  protein of unknown function DUF1469  31.25 
 
 
142 aa  45.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27570  Protein of unknown function (DUF1469)  39.51 
 
 
138 aa  44.7  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6022  hypothetical protein  37.97 
 
 
156 aa  43.9  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1378  hypothetical protein  30.5 
 
 
169 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0194818  normal  0.100632 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2073  protein of unknown function DUF1469  36.36 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0347  hypothetical protein  34.23 
 
 
140 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1384  protein of unknown function DUF1469  36.44 
 
 
148 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000799445  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4774  protein of unknown function DUF1469  36.49 
 
 
151 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.487422  normal  0.301166 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1772  hypothetical protein  33.33 
 
 
151 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1591  hypothetical protein  32.56 
 
 
151 aa  40.4  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>