More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0164 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0164  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 550 aa  1097    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5772  extracellular solute-binding protein  40 
 
 		 534 aa  344  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.228919  normal  0.273878 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0927  extracellular solute-binding protein family 5  38.63 
 
 		 544 aa  298  2e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.887829  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1084  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  29.96 
 
 		 539 aa  182  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1248  extracellular solute-binding protein  29.65 
 
 		 537 aa  152  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.710714 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3088  extracellular solute-binding protein  31.73 
 
 		 538 aa  144  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.902972  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0038  extracellular solute-binding protein  30.35 
 
 		 532 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.216937  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2197  extracellular solute-binding protein family 5  29.01 
 
 		 556 aa  138  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0799  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 		 531 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.162067  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1917  extracellular solute-binding protein  26.94 
 
 		 518 aa  131  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2465  extracellular solute-binding protein  25.44 
 
 		 529 aa  127  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.352303 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3888  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  25.33 
 
 		 550 aa  127  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.799639  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1030  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  27.58 
 
 		 534 aa  127  7e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.180664  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1906  extracellular solute-binding protein  27.22 
 
 		 543 aa  126  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0377443  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0807  ABC dipeptide transporter, substrate-binding subunit DdpA  25.64 
 
 		 538 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123514  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0372  extracellular solute-binding protein  25.64 
 
 		 529 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.132597  normal  0.149219 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  24.25 
 
 		 515 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0403  twin-arginine translocation pathway signal  27.88 
 
 		 559 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3686  extracellular solute-binding protein  27.29 
 
 		 522 aa  121  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3551  ABC dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, periplasmic dipeptide/oligopeptide/nickel-binding protein  27.29 
 
 		 522 aa  121  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2047  extracellular solute-binding protein  28.83 
 
 		 529 aa  120  7.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.101703  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3198  extracellular solute-binding protein  26.68 
 
 		 547 aa  119  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.271789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3741  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 		 532 aa  118  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2713  extracellular solute-binding protein  27 
 
 		 529 aa  118  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.98 
 
 		 540 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00232176  normal  0.206883 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2056  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 		 521 aa  117  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3829  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 		 569 aa  116  7.999999999999999e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.847313 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3528  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 		 564 aa  116  8.999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.61993  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  29.91 
 
 		 510 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2706  extracellular solute-binding protein  29.85 
 
 		 538 aa  114  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.723031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1105  extracellular solute-binding protein  25.51 
 
 		 522 aa  114  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4180  extracellular solute-binding protein family 5  26.84 
 
 		 547 aa  114  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2916  4-phytase  29.35 
 
 		 522 aa  113  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2326  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 		 546 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.294702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5173  extracellular solute-binding protein family 5  27.01 
 
 		 528 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12226  normal  0.127243 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2532  extracellular solute-binding protein family 5  27.42 
 
 		 525 aa  111  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5442  extracellular solute-binding protein family 5  27.01 
 
 		 528 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0169825 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3852  extracellular solute-binding protein family 5  26.43 
 
 		 547 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  25.51 
 
 		 516 aa  109  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19540  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.77 
 
 		 567 aa  108  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.394832  normal  0.058637 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3449  extracellular solute-binding protein family 5  29.38 
 
 		 515 aa  107  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.802426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1571  4-phytase  28.01 
 
 		 510 aa  106  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1855  twin-arginine translocation pathway signal  27.54 
 
 		 540 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686889  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1965  extracellular solute-binding protein family 5  28.5 
 
 		 556 aa  106  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  29.74 
 
 		 511 aa  104  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1804  extracellular solute-binding protein  29.54 
 
 		 520 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.12787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1823  extracellular solute-binding protein  29.54 
 
 		 520 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214721  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1870  extracellular solute-binding protein  29.54 
 
 		 520 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0925  extracellular solute-binding protein family 5  27.92 
 
 		 523 aa  103  8e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.30323 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1878  extracellular solute-binding protein  29.22 
 
 		 536 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0553  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 		 522 aa  102  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.727867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1692  extracellular solute-binding protein family 5  27.94 
 
 		 531 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.122173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  26 
 
 		 516 aa  101  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1878  extracellular solute-binding protein family 5  27.25 
 
 		 531 aa  101  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.558624  normal  0.335683 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1880  extracellular solute-binding protein  25.51 
 
 		 536 aa  100  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.70178  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3602  extracellular solute-binding protein family 5  25.73 
 
 		 514 aa  100  7e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.190113  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1024  extracellular solute-binding protein  27.02 
 
 		 524 aa  100  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216522 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1847  extracellular solute-binding protein  33.94 
 
 		 526 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.068039  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1828  extracellular solute-binding protein  33.94 
 
 		 526 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1255  extracellular solute-binding protein family 5  23.24 
 
 		 566 aa  99.8  1e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1894  extracellular solute-binding protein  33.94 
 
 		 526 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.567427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0480  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 569 aa  98.6  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105843  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0645  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  23.2 
 
 		 524 aa  99.4  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2653  extracellular solute-binding protein  27.89 
 
 		 517 aa  99  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0051152  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  24.9 
 
 		 523 aa  98.6  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0473  nickel ABC transporter, solute-binding protein  24.45 
 
 		 538 aa  97.8  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1427  solute-binding family 5 protein  25.14 
 
 		 533 aa  97.8  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.23 
 
 		 504 aa  97.4  7e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0803154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0135  extracellular solute-binding protein family 5  23.52 
 
 		 531 aa  97.1  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0469  extracellular solute-binding protein family 5  22.97 
 
 		 552 aa  97.1  8e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3993  extracellular solute-binding protein family 5  22.49 
 
 		 531 aa  97.1  8e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3537  extracellular solute-binding protein  24.83 
 
 		 556 aa  97.1  8e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4044  extracellular solute-binding protein family 5  26.67 
 
 		 536 aa  95.5  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1442  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.29 
 
 		 563 aa  95.1  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.663118  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58360  putative binding protein component of ABC transpor  24.31 
 
 		 532 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  26.99 
 
 		 530 aa  94.7  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01445  D-ala-D-a la transporter subunit  32.24 
 
 		 516 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2160  extracellular solute-binding protein family 5  32.24 
 
 		 516 aa  94.7  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0024579  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2226  extracellular solute-binding protein family 5  29.08 
 
 		 507 aa  94.7  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0969064 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1572  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  32.24 
 
 		 516 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1686  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  32.24 
 
 		 516 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1097  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein, putative  28.05 
 
 		 518 aa  94.4  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1562  extracellular solute-binding protein  26.97 
 
 		 556 aa  94.4  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.278775  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3666  extracellular solute-binding protein family 5  28.21 
 
 		 563 aa  94.4  5e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  28.03 
 
 		 525 aa  94.4  5e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1799  extracellular solute-binding protein family 5  23.85 
 
 		 531 aa  94  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0907769  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7644  extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 		 528 aa  94  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.938913  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  30.29 
 
 		 631 aa  93.6  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2099  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  31.78 
 
 		 516 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.98 
 
 		 520 aa  93.2  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2170  extracellular solute-binding protein  31.78 
 
 		 516 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1750  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  35.06 
 
 		 516 aa  93.2  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.843018  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3508  extracellular solute-binding protein family 5  27.65 
 
 		 508 aa  93.2  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0424359 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1781  extracellular solute-binding protein  25.56 
 
 		 501 aa  93.2  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000533035  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0872  extracellular solute-binding protein family 5  27.18 
 
 		 527 aa  92.4  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0206  extracellular solute-binding protein family 5  24.78 
 
 		 561 aa  92.4  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.646254  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3308  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 		 528 aa  92  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.705056 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3867  extracellular solute-binding protein family 5  26.67 
 
 		 536 aa  92.8  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  28.83 
 
 		 512 aa  92  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3437  extracellular solute-binding protein  27.29 
 
 		 492 aa  92.8  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58601  normal  0.852102 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>