More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A2076 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A2076  surface presentation of antigens protein SpaS  100 
 
 		 411 aa  830    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1533  surface presentation of antigens protein SpaS  99.51 
 
 		 411 aa  823    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0573  surface presentation of antigens protein SpaS  99.27 
 
 		 411 aa  821    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.406609  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0751  surface presentation of antigens protein SpaS  99.51 
 
 		 411 aa  823    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.149273  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0839  surface presentation of antigens protein SpaS  90.96 
 
 		 381 aa  665    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2164  surface presentation of antigens protein SpaS  98.54 
 
 		 406 aa  754    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2071  surface presentation of antigens protein SpaS  99.51 
 
 		 411 aa  823    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.086614  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4137  surface presentation of antigens protein SpaS  41.87 
 
 		 373 aa  300  3e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465227 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3009  surface presentation of antigens protein SpaS  44.41 
 
 		 356 aa  296  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3077  surface presentation of antigens protein SpaS  44.41 
 
 		 356 aa  296  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3197  surface presentation of antigens protein SpaS  44.41 
 
 		 356 aa  296  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3092  surface presentation of antigens protein SpaS  44.41 
 
 		 356 aa  296  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000792926 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3040  surface presentation of antigens protein SpaS  44.41 
 
 		 356 aa  296  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.110418 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0190  surface presentation of antigens protein SpaS  40.52 
 
 		 342 aa  278  1e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003359  type III secretion inner membrane protein HrpY  37.14 
 
 		 351 aa  188  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01723  Type III secretory pathway, component EscU  33.99 
 
 		 349 aa  182  7e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3181  FlhB/HrpN/YscU/SpaS family protein  41.03 
 
 		 243 aa  177  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0048  type III secretion appartus protein YscU  34.29 
 
 		 354 aa  173  3.9999999999999995e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000158953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42660  translocation protein in type III secretion  36 
 
 		 349 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2281  secretion system apparatus protein SsaU  34.25 
 
 		 349 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0436639  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1977  secretion system apparatus protein SsaU  35.06 
 
 		 349 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2412  type III secretion protein, YscU/HrpY family  30.79 
 
 		 346 aa  145  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1921  secretion system apparatus protein SsaU  32.74 
 
 		 352 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.133432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3011  YscD family type III secretion protein  31.16 
 
 		 346 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.859866  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1532  secretion system apparatus protein SsaU  32.74 
 
 		 352 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.371934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1205  type III secretion protein HrcU  29.46 
 
 		 359 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.322672  normal  0.485565 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1555  secretion system apparatus protein SsaU  32.74 
 
 		 352 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1518  secretion system apparatus protein SsaU  32.24 
 
 		 352 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00925486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03402  type III secretion system protein HrcU  32.2 
 
 		 359 aa  139  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1752  secretion system apparatus protein SsaU  32.44 
 
 		 352 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152464  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0366  type III secretion system protein  27.51 
 
 		 360 aa  138  2e-31  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3926  secretion system apparatus protein SsaU  31.6 
 
 		 355 aa  138  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5071  secretion system apparatus protein SsaU  30.67 
 
 		 345 aa  136  7.000000000000001e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.796147  normal  0.0581283 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3899  secretion system apparatus protein SsaU  31.71 
 
 		 355 aa  136  8e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1392  type III secretion protein HrcU  29.29 
 
 		 359 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1882  type III secretion protein, YscU/HrpY family  29.36 
 
 		 361 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3811  secretion system apparatus protein SsaU  30.98 
 
 		 356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1674  flagellar biosynthetic protein FlhB  29.43 
 
 		 360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1904  type III secretion system protein HrcU  29.47 
 
 		 352 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0427  type III secretion system protein HrcU  29.47 
 
 		 352 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0498216  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1996  type III secretion system protein HrcU  29.47 
 
 		 352 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920837  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0750  type III secretion system protein HrcU  29.39 
 
 		 360 aa  131  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0905461  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0049  YscU/HrpY family type III secretion protein  29.08 
 
 		 359 aa  130  6e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2199  type III secretion system protein HrcU  30.06 
 
 		 420 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706014  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0680  type III secretion system protein HrcU  30.06 
 
 		 399 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0663628  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0868  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein  28.53 
 
 		 369 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2282  type III secretion system protein HrcU  30.06 
 
 		 420 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.58403  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  28.08 
 
 		 374 aa  127  5e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000937461  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0453  type III secretion system protein HrcU  29.46 
 
 		 352 aa  127  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.0822049 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1623  flagellar biosynthesis protein FlhB  28.17 
 
 		 362 aa  126  9e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0342  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.1 
 
 		 357 aa  126  9e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00837822  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  27.76 
 
 		 374 aa  125  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000395256  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2215  type III secretion protein, YscU/HrpY family  26.56 
 
 		 359 aa  124  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2159  flagellar biosynthetic protein FlhB  27.87 
 
 		 377 aa  124  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16690  flagellar biosynthetic protein FlhB  29.19 
 
 		 356 aa  123  6e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2393  flagellar biosynthetic protein FlhB  28.44 
 
 		 354 aa  123  6e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0380  flagellar biosynthesis protein FlhB  28.53 
 
 		 362 aa  122  8e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.441846  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1631  type III secretion system protein HrcU  29.76 
 
 		 360 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.882123  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1339  flagellar biosynthesis protein FlhB  25.5 
 
 		 377 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0357  flagellar biosynthesis protein FlhB  28.53 
 
 		 368 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1954  type III secretion system protein HrcU  29.46 
 
 		 420 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0634  type III secretion system protein HrcU  29.46 
 
 		 420 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1981  flagellar biosynthesis protein FlhB  25.41 
 
 		 378 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.764273  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0864  type III secretion system protein HrcU  29.67 
 
 		 357 aa  119  7e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479024 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0484  flagellar biosynthetic protein FlhB  25 
 
 		 392 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0127914  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1866  flagellar biosynthesis protein FlhB  27.81 
 
 		 376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.965675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1195  flagellar biosynthesis protein FlhB  26.61 
 
 		 377 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1397  flagellar biosynthetic protein FlhB  27.04 
 
 		 363 aa  117  3e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0999  flagellar biosynthesis protein FlhB  27.73 
 
 		 357 aa  117  3.9999999999999997e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1515  flagellar biosynthesis protein FlhB  27.44 
 
 		 376 aa  114  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.813027  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1334  flagellar biosynthetic protein FlhB  28.44 
 
 		 384 aa  113  5e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1374  flagellar biosynthesis protein FlhB  26.3 
 
 		 377 aa  113  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0959  type III secretion exporter  27.32 
 
 		 377 aa  113  6e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0981  flagellar biosynthetic protein FlhB  26.52 
 
 		 390 aa  113  6e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800953 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0426  flagellar biosynthesis protein FlhB  28.66 
 
 		 352 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02874  flagellar biosynthesis protein  26.59 
 
 		 374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3053  flagellar biosynthesis protein FlhB  24.3 
 
 		 377 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535555 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1379  flagellar biosynthesis protein FlhB  25.47 
 
 		 377 aa  111  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0623  flagellar biosynthesis protein FlhB  28.31 
 
 		 377 aa  111  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0240  flagellar biosynthetic protein FlhB  29.32 
 
 		 353 aa  110  3e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.760621  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1137  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.09 
 
 		 359 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0669  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.28 
 
 		 350 aa  110  5e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0757109  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2809  flagellar biosynthesis protein FlhB  27.22 
 
 		 378 aa  110  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.326255  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1245  flagellar biosynthetic protein FlhB  26.69 
 
 		 390 aa  110  6e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1412  flagellar biosynthetic protein FlhB  28.09 
 
 		 363 aa  110  6e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342211  normal  0.890154 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3390  flagellar biosynthesis protein FlhB  29 
 
 		 379 aa  110  6e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1330  flagellar biosynthesis protein FlhB  27.13 
 
 		 358 aa  109  7.000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0043  type III secretion exporter  27.1 
 
 		 352 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4412  type III secretion exporter  26.67 
 
 		 390 aa  109  7.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5857  type III secretion system protein HrcU  27.88 
 
 		 352 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4406  flagellar biosynthesis protein FlhB  28.4 
 
 		 357 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.202983  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1631  flagellar biosynthesis protein FlhB  26.09 
 
 		 377 aa  108  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1316  flagellar biosynthetic protein FlhB  27.91 
 
 		 366 aa  108  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3441  flagellar biosynthesis protein FlhB  25.39 
 
 		 378 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0242  flagellar biosynthesis protein FlhB  28.7 
 
 		 379 aa  108  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5640  type III secretion system protein HrcU  27.49 
 
 		 352 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.122414 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0242  flagellar biosynthesis protein FlhB  27.71 
 
 		 377 aa  108  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.33455  normal  0.0187302 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45720  flagellar biosynthesis protein FlhB  28.44 
 
 		 378 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0086  flagellar biosynthetic protein FlhB  26.55 
 
 		 376 aa  108  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.293777 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1592  flagellar biosynthesis protein FlhB  25.77 
 
 		 348 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>