More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSp0864 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RSp0864  type III secretion system protein HrcU  100 
 
 
357 aa  717    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479024 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03402  type III secretion system protein HrcU  48.84 
 
 
359 aa  332  8e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1904  type III secretion system protein HrcU  50 
 
 
352 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0427  type III secretion system protein HrcU  50 
 
 
352 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0498216  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1996  type III secretion system protein HrcU  49.71 
 
 
352 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920837  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5640  type III secretion system protein HrcU  45.03 
 
 
352 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.122414 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5857  type III secretion system protein HrcU  44.74 
 
 
352 aa  291  9e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0750  type III secretion system protein HrcU  44.51 
 
 
360 aa  290  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0905461  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2199  type III secretion system protein HrcU  47.29 
 
 
420 aa  279  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706014  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0680  type III secretion system protein HrcU  47.29 
 
 
399 aa  279  6e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0663628  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2282  type III secretion system protein HrcU  46.99 
 
 
420 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.58403  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1631  type III secretion system protein HrcU  46.43 
 
 
360 aa  276  5e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.882123  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0634  type III secretion system protein HrcU  46.69 
 
 
420 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1954  type III secretion system protein HrcU  46.69 
 
 
420 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0453  type III secretion system protein HrcU  42.09 
 
 
352 aa  272  6e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.0822049 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5932  type III secretion system protein HrcU  44.38 
 
 
357 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.897512  normal  0.0426598 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0342  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.57 
 
 
357 aa  199  6e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00837822  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0484  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.67 
 
 
392 aa  189  4e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0127914  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2215  type III secretion protein, YscU/HrpY family  35.28 
 
 
359 aa  189  5.999999999999999e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1866  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.03 
 
 
376 aa  188  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.965675  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1397  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.31 
 
 
363 aa  188  1e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1330  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.72 
 
 
358 aa  187  2e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0011  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.65 
 
 
355 aa  187  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0357  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.72 
 
 
368 aa  186  5e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0380  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.33 
 
 
362 aa  183  3e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.441846  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0703  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.16 
 
 
354 aa  184  3e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.635027  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3011  YscD family type III secretion protein  35.63 
 
 
346 aa  184  3e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.859866  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2412  type III secretion protein, YscU/HrpY family  36.16 
 
 
346 aa  182  6e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1674  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.96 
 
 
360 aa  182  6e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1882  type III secretion protein, YscU/HrpY family  35.07 
 
 
361 aa  182  7e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1623  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.14 
 
 
362 aa  181  2e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003359  type III secretion inner membrane protein HrpY  33.06 
 
 
351 aa  179  4.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3899  secretion system apparatus protein SsaU  34.77 
 
 
355 aa  179  8e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0426  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.14 
 
 
352 aa  178  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0999  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.29 
 
 
357 aa  178  1e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2604  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.45 
 
 
383 aa  177  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3811  secretion system apparatus protein SsaU  34.01 
 
 
356 aa  178  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2696  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.23 
 
 
373 aa  177  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0740  type III secretion exporter  36.44 
 
 
381 aa  177  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1129  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.44 
 
 
360 aa  176  4e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1547  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.18 
 
 
383 aa  176  5e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3926  secretion system apparatus protein SsaU  33.72 
 
 
355 aa  176  8e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01723  Type III secretory pathway, component EscU  32.33 
 
 
349 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1392  type III secretion protein HrcU  34.1 
 
 
359 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0049  YscU/HrpY family type III secretion protein  33.99 
 
 
359 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4066  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.22 
 
 
387 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4178  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.22 
 
 
387 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.232408  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1394  flagellar biosynthetic FlhB transmembrane protein  33.43 
 
 
387 aa  172  9e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00896638  normal  0.765457 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1862  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.61 
 
 
383 aa  172  9e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90359  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3804  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.88 
 
 
403 aa  172  9e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0868  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein  31.25 
 
 
369 aa  172  9e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2154  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.79 
 
 
366 aa  172  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1163  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.95 
 
 
351 aa  172  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3170  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.93 
 
 
405 aa  171  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2393  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.08 
 
 
354 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0130  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.63 
 
 
406 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561684  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1205  type III secretion protein HrcU  33.43 
 
 
359 aa  169  7e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.322672  normal  0.485565 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16690  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.39 
 
 
356 aa  169  7e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3370  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.71 
 
 
398 aa  169  7e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00184569  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3698  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.53 
 
 
380 aa  169  7e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0239481 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0048  type III secretion appartus protein YscU  30.56 
 
 
354 aa  168  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000158953  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1921  secretion system apparatus protein SsaU  33.14 
 
 
352 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.133432  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3128  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.37 
 
 
401 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1532  secretion system apparatus protein SsaU  33.14 
 
 
352 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.371934  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2169  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.56 
 
 
376 aa  168  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1695  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.37 
 
 
401 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1555  secretion system apparatus protein SsaU  33.14 
 
 
352 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3423  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.37 
 
 
401 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2847  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.37 
 
 
405 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0600  type III secretion exporter  33.9 
 
 
391 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0981  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.69 
 
 
390 aa  168  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0800953 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3925  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.37 
 
 
401 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.807758  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4412  type III secretion exporter  32.27 
 
 
390 aa  168  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0063  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.08 
 
 
405 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3844  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.08 
 
 
401 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0959  type III secretion exporter  32.69 
 
 
377 aa  166  5e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2840  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.9 
 
 
399 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.151701  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0267  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.9 
 
 
399 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110201  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1752  secretion system apparatus protein SsaU  32.85 
 
 
352 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152464  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1515  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.49 
 
 
376 aa  165  9e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.813027  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1944  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.2 
 
 
381 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1518  secretion system apparatus protein SsaU  32.56 
 
 
352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00925486  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0249  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.63 
 
 
399 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190542  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1379  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.53 
 
 
377 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1930  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.52 
 
 
363 aa  164  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.922236  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1339  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.73 
 
 
377 aa  164  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1374  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.13 
 
 
377 aa  164  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0669  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.32 
 
 
350 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0757109  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0240  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.12 
 
 
353 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.760621  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3821  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.87 
 
 
353 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5615  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.99 
 
 
380 aa  162  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.891713  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4137  surface presentation of antigens protein SpaS  29.75 
 
 
373 aa  162  7e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465227 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3819  type III secretion exporter  31.73 
 
 
390 aa  162  8.000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.414984 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3053  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.8 
 
 
377 aa  161  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0535555 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3092  type III secretion exporter  31.44 
 
 
390 aa  161  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.677478  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2617  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.7 
 
 
382 aa  160  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000137265 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1245  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.14 
 
 
390 aa  160  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215857  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1195  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.25 
 
 
377 aa  160  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1981  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.17 
 
 
378 aa  160  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.764273  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0743  flagellar biosynthetic protein FlhB  29.58 
 
 
381 aa  160  4e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>