More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003359 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_003359  type III secretion inner membrane protein HrpY  100 
 
 
351 aa  714    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01723  Type III secretory pathway, component EscU  88.51 
 
 
349 aa  647    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0048  type III secretion appartus protein YscU  61.29 
 
 
354 aa  436  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000158953  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42660  translocation protein in type III secretion  63.69 
 
 
349 aa  423  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2412  type III secretion protein, YscU/HrpY family  41.86 
 
 
346 aa  292  6e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3011  YscD family type III secretion protein  40.99 
 
 
346 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.859866  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2281  secretion system apparatus protein SsaU  37.46 
 
 
349 aa  236  4e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0436639  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16690  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.57 
 
 
356 aa  233  5e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1977  secretion system apparatus protein SsaU  36.89 
 
 
349 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5071  secretion system apparatus protein SsaU  35.99 
 
 
345 aa  222  7e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.796147  normal  0.0581283 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3926  secretion system apparatus protein SsaU  36.47 
 
 
355 aa  216  4e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1129  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.49 
 
 
360 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3899  secretion system apparatus protein SsaU  36.18 
 
 
355 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0743  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.28 
 
 
381 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0703  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.21 
 
 
354 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.635027  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3811  secretion system apparatus protein SsaU  35.9 
 
 
356 aa  213  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0366  type III secretion system protein  34.73 
 
 
360 aa  212  1e-53  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4135  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.48 
 
 
350 aa  210  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0846766  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0011  flagellar biosynthetic protein FlhB  34 
 
 
355 aa  210  3e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2393  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.02 
 
 
354 aa  210  4e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03402  type III secretion system protein HrcU  34.45 
 
 
359 aa  209  8e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1518  secretion system apparatus protein SsaU  35.26 
 
 
352 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00925486  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0453  type III secretion system protein HrcU  34.49 
 
 
352 aa  206  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.0822049 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1555  secretion system apparatus protein SsaU  34.97 
 
 
352 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1532  secretion system apparatus protein SsaU  34.97 
 
 
352 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.371934  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1981  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.31 
 
 
378 aa  204  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.764273  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1752  secretion system apparatus protein SsaU  34.97 
 
 
352 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152464  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1921  secretion system apparatus protein SsaU  34.97 
 
 
352 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.133432  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0484  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.29 
 
 
392 aa  204  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0127914  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0981  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.83 
 
 
390 aa  201  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0800953 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0380  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.01 
 
 
362 aa  199  6e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.441846  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0379  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.9 
 
 
357 aa  199  7e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1391  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.38 
 
 
360 aa  197  2.0000000000000003e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0357  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.17 
 
 
368 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1412  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.03 
 
 
363 aa  197  3e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342211  normal  0.890154 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1205  type III secretion protein HrcU  34.29 
 
 
359 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.322672  normal  0.485565 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1866  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.33 
 
 
376 aa  197  3e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.965675  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1334  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.82 
 
 
384 aa  197  3e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1750  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.9 
 
 
382 aa  196  4.0000000000000005e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1750  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.9 
 
 
382 aa  196  5.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0658  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.16 
 
 
353 aa  195  8.000000000000001e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.622115  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2215  type III secretion protein, YscU/HrpY family  32.12 
 
 
359 aa  195  9e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2696  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.8 
 
 
373 aa  195  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0868  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein  33.14 
 
 
369 aa  195  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0342  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.81 
 
 
357 aa  195  1e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00837822  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4137  surface presentation of antigens protein SpaS  34.78 
 
 
373 aa  194  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465227 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0049  YscU/HrpY family type III secretion protein  34.94 
 
 
359 aa  193  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1623  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.89 
 
 
362 aa  194  3e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1930  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.39 
 
 
363 aa  193  3e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.922236  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1996  type III secretion system protein HrcU  35.33 
 
 
352 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920837  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1882  type III secretion protein, YscU/HrpY family  32.58 
 
 
361 aa  193  5e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1904  type III secretion system protein HrcU  35.33 
 
 
352 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0427  type III secretion system protein HrcU  35.33 
 
 
352 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0498216  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0669  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.29 
 
 
350 aa  192  7e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0757109  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1392  type III secretion protein HrcU  35.04 
 
 
359 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1674  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.86 
 
 
360 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1547  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.64 
 
 
383 aa  190  4e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5640  type III secretion system protein HrcU  34.57 
 
 
352 aa  190  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.122414 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0130  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.9 
 
 
406 aa  190  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561684  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5857  type III secretion system protein HrcU  34.57 
 
 
352 aa  190  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  30.86 
 
 
374 aa  189  4e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000937461  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3804  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.95 
 
 
403 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0092  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.05 
 
 
376 aa  188  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  30.56 
 
 
374 aa  188  1e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000395256  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2069  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.43 
 
 
383 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00553621 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2432  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.33 
 
 
386 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2334  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.59 
 
 
386 aa  188  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.178036  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0573  surface presentation of antigens protein SpaS  37.14 
 
 
411 aa  186  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.406609  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0839  surface presentation of antigens protein SpaS  36.29 
 
 
381 aa  186  5e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3484  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.43 
 
 
376 aa  186  5e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.994028  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2154  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.49 
 
 
366 aa  186  6e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1533  surface presentation of antigens protein SpaS  37.14 
 
 
411 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0751  surface presentation of antigens protein SpaS  37.14 
 
 
411 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.149273  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2164  surface presentation of antigens protein SpaS  37.14 
 
 
406 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2071  surface presentation of antigens protein SpaS  37.14 
 
 
411 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.086614  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2074  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.14 
 
 
383 aa  185  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000897295 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1208  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.14 
 
 
383 aa  185  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2129  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.86 
 
 
383 aa  185  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000192021 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4406  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.39 
 
 
357 aa  185  9e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.202983  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1331  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.86 
 
 
383 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  hitchhiker  0.0000000000516194 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2076  surface presentation of antigens protein SpaS  37.14 
 
 
411 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2032  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.7 
 
 
381 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.112007  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1163  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.47 
 
 
351 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2447  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.33 
 
 
382 aa  183  4.0000000000000006e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0086  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.99 
 
 
376 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.293777 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1384  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.85 
 
 
360 aa  182  6e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.696508  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1515  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.22 
 
 
376 aa  181  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.813027  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1379  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.26 
 
 
377 aa  182  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2964  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.85 
 
 
411 aa  182  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00775742 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0240  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.24 
 
 
353 aa  181  2e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.760621  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2809  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.9 
 
 
378 aa  181  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.326255  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1862  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.76 
 
 
383 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90359  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002828  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.19 
 
 
376 aa  180  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3667  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.05 
 
 
376 aa  179  4e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3077  surface presentation of antigens protein SpaS  30.77 
 
 
356 aa  180  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3197  surface presentation of antigens protein SpaS  30.77 
 
 
356 aa  180  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3040  surface presentation of antigens protein SpaS  30.77 
 
 
356 aa  180  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.110418 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3092  surface presentation of antigens protein SpaS  30.77 
 
 
356 aa  180  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000792926 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0069  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.76 
 
 
358 aa  179  4.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3217  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.96 
 
 
354 aa  179  7e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.447718 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>